Protein–RNA interactions for Protein: Q5MJS3

Fam20c, Extracellular serine/threonine protein kinase FAM20C, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam20cQ5MJS3 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fam20cQ5MJS3 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fam20cQ5MJS3 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fam20cQ5MJS3 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fam20cQ5MJS3 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fam20cQ5MJS3 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fam20cQ5MJS3 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fam20cQ5MJS3 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fam20cQ5MJS3 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fam20cQ5MJS3 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fam20cQ5MJS3 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fam20cQ5MJS3 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fam20cQ5MJS3 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fam20cQ5MJS3 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Fam20cQ5MJS3 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fam20cQ5MJS3 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fam20cQ5MJS3 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fam20cQ5MJS3 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fam20cQ5MJS3 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fam20cQ5MJS3 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fam20cQ5MJS3 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fam20cQ5MJS3 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fam20cQ5MJS3 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fam20cQ5MJS3 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fam20cQ5MJS3 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fam20cQ5MJS3 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fam20cQ5MJS3 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fam20cQ5MJS3 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fam20cQ5MJS3 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fam20cQ5MJS3 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fam20cQ5MJS3 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fam20cQ5MJS3 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fam20cQ5MJS3 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fam20cQ5MJS3 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fam20cQ5MJS3 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fam20cQ5MJS3 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fam20cQ5MJS3 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Fam20cQ5MJS3 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fam20cQ5MJS3 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Fam20cQ5MJS3 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Fam20cQ5MJS3 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fam20cQ5MJS3 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fam20cQ5MJS3 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Fam20cQ5MJS3 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Fam20cQ5MJS3 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Fam20cQ5MJS3 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fam20cQ5MJS3 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fam20cQ5MJS3 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fam20cQ5MJS3 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fam20cQ5MJS3 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fam20cQ5MJS3 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Fam20cQ5MJS3 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
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Fam20cQ5MJS3 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fam20cQ5MJS3 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fam20cQ5MJS3 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fam20cQ5MJS3 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fam20cQ5MJS3 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Fam20cQ5MJS3 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Fam20cQ5MJS3 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fam20cQ5MJS3 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fam20cQ5MJS3 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fam20cQ5MJS3 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fam20cQ5MJS3 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Fam20cQ5MJS3 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Fam20cQ5MJS3 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Fam20cQ5MJS3 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fam20cQ5MJS3 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fam20cQ5MJS3 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fam20cQ5MJS3 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fam20cQ5MJS3 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fam20cQ5MJS3 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fam20cQ5MJS3 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fam20cQ5MJS3 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fam20cQ5MJS3 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fam20cQ5MJS3 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fam20cQ5MJS3 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fam20cQ5MJS3 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fam20cQ5MJS3 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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