Protein–RNA interactions for Protein: Q5HZG4

Taf3, Transcription initiation factor TFIID subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 932 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf3Q5HZG4 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Taf3Q5HZG4 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Taf3Q5HZG4 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Taf3Q5HZG4 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Taf3Q5HZG4 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Taf3Q5HZG4 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Taf3Q5HZG4 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Taf3Q5HZG4 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Taf3Q5HZG4 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Taf3Q5HZG4 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Taf3Q5HZG4 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Taf3Q5HZG4 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Taf3Q5HZG4 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Taf3Q5HZG4 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Taf3Q5HZG4 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Taf3Q5HZG4 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Taf3Q5HZG4 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Taf3Q5HZG4 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Taf3Q5HZG4 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Taf3Q5HZG4 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Taf3Q5HZG4 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Taf3Q5HZG4 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Taf3Q5HZG4 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Taf3Q5HZG4 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Taf3Q5HZG4 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Taf3Q5HZG4 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Taf3Q5HZG4 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Taf3Q5HZG4 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Taf3Q5HZG4 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Taf3Q5HZG4 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Taf3Q5HZG4 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Taf3Q5HZG4 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Taf3Q5HZG4 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Taf3Q5HZG4 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Taf3Q5HZG4 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Taf3Q5HZG4 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Taf3Q5HZG4 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Taf3Q5HZG4 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Taf3Q5HZG4 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Taf3Q5HZG4 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Taf3Q5HZG4 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Taf3Q5HZG4 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Taf3Q5HZG4 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Taf3Q5HZG4 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Taf3Q5HZG4 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Taf3Q5HZG4 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Taf3Q5HZG4 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Taf3Q5HZG4 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Taf3Q5HZG4 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Taf3Q5HZG4 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Taf3Q5HZG4 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Taf3Q5HZG4 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Taf3Q5HZG4 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Taf3Q5HZG4 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Taf3Q5HZG4 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Taf3Q5HZG4 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Taf3Q5HZG4 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Taf3Q5HZG4 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Taf3Q5HZG4 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Taf3Q5HZG4 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Taf3Q5HZG4 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Taf3Q5HZG4 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Taf3Q5HZG4 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Taf3Q5HZG4 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Taf3Q5HZG4 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Taf3Q5HZG4 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Taf3Q5HZG4 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Taf3Q5HZG4 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Taf3Q5HZG4 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Taf3Q5HZG4 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Taf3Q5HZG4 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Taf3Q5HZG4 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Taf3Q5HZG4 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Taf3Q5HZG4 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Taf3Q5HZG4 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Taf3Q5HZG4 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Taf3Q5HZG4 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Taf3Q5HZG4 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Taf3Q5HZG4 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Taf3Q5HZG4 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Taf3Q5HZG4 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Taf3Q5HZG4 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Taf3Q5HZG4 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Taf3Q5HZG4 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Taf3Q5HZG4 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Taf3Q5HZG4 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Taf3Q5HZG4 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Taf3Q5HZG4 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Taf3Q5HZG4 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Taf3Q5HZG4 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Taf3Q5HZG4 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Taf3Q5HZG4 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Taf3Q5HZG4 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Taf3Q5HZG4 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Taf3Q5HZG4 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Taf3Q5HZG4 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Taf3Q5HZG4 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Taf3Q5HZG4 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Taf3Q5HZG4 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Taf3Q5HZG4 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms