Protein–RNA interactions for Protein: Q3V038

Ttc9, Tetratricopeptide repeat protein 9A, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9Q3V038 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ttc9Q3V038 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ttc9Q3V038 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ttc9Q3V038 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ttc9Q3V038 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ttc9Q3V038 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ttc9Q3V038 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ttc9Q3V038 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ttc9Q3V038 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ttc9Q3V038 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ttc9Q3V038 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ttc9Q3V038 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ttc9Q3V038 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ttc9Q3V038 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ttc9Q3V038 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ttc9Q3V038 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ttc9Q3V038 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ttc9Q3V038 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ttc9Q3V038 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ttc9Q3V038 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ttc9Q3V038 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ttc9Q3V038 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ttc9Q3V038 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ttc9Q3V038 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ttc9Q3V038 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ttc9Q3V038 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ttc9Q3V038 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ttc9Q3V038 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ttc9Q3V038 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ttc9Q3V038 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ttc9Q3V038 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ttc9Q3V038 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ttc9Q3V038 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ttc9Q3V038 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ttc9Q3V038 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ttc9Q3V038 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ttc9Q3V038 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ttc9Q3V038 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ttc9Q3V038 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ttc9Q3V038 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ttc9Q3V038 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ttc9Q3V038 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ttc9Q3V038 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ttc9Q3V038 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ttc9Q3V038 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ttc9Q3V038 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ttc9Q3V038 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ttc9Q3V038 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ttc9Q3V038 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ttc9Q3V038 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ttc9Q3V038 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ttc9Q3V038 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ttc9Q3V038 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ttc9Q3V038 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ttc9Q3V038 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ttc9Q3V038 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ttc9Q3V038 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ttc9Q3V038 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ttc9Q3V038 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ttc9Q3V038 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ttc9Q3V038 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ttc9Q3V038 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ttc9Q3V038 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ttc9Q3V038 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ttc9Q3V038 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ttc9Q3V038 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ttc9Q3V038 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ttc9Q3V038 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ttc9Q3V038 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ttc9Q3V038 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ttc9Q3V038 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ttc9Q3V038 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ttc9Q3V038 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ttc9Q3V038 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ttc9Q3V038 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ttc9Q3V038 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ttc9Q3V038 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ttc9Q3V038 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ttc9Q3V038 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Ttc9Q3V038 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ttc9Q3V038 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ttc9Q3V038 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ttc9Q3V038 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ttc9Q3V038 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ttc9Q3V038 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ttc9Q3V038 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ttc9Q3V038 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ttc9Q3V038 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ttc9Q3V038 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Ttc9Q3V038 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Ttc9Q3V038 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Ttc9Q3V038 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ttc9Q3V038 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Ttc9Q3V038 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ttc9Q3V038 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ttc9Q3V038 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ttc9Q3V038 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ttc9Q3V038 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ttc9Q3V038 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ttc9Q3V038 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.8 ms