Protein–RNA interactions for Protein: Q3UP24

Nlrc4, NLR family CARD domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 1,024 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrc4Q3UP24 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Nlrc4Q3UP24 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nlrc4Q3UP24 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nlrc4Q3UP24 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nlrc4Q3UP24 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nlrc4Q3UP24 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Nlrc4Q3UP24 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nlrc4Q3UP24 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Nlrc4Q3UP24 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nlrc4Q3UP24 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nlrc4Q3UP24 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nlrc4Q3UP24 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nlrc4Q3UP24 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nlrc4Q3UP24 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nlrc4Q3UP24 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nlrc4Q3UP24 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nlrc4Q3UP24 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nlrc4Q3UP24 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nlrc4Q3UP24 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nlrc4Q3UP24 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nlrc4Q3UP24 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nlrc4Q3UP24 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nlrc4Q3UP24 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nlrc4Q3UP24 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nlrc4Q3UP24 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nlrc4Q3UP24 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nlrc4Q3UP24 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nlrc4Q3UP24 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nlrc4Q3UP24 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nlrc4Q3UP24 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nlrc4Q3UP24 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nlrc4Q3UP24 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nlrc4Q3UP24 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nlrc4Q3UP24 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nlrc4Q3UP24 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nlrc4Q3UP24 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nlrc4Q3UP24 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nlrc4Q3UP24 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nlrc4Q3UP24 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nlrc4Q3UP24 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nlrc4Q3UP24 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nlrc4Q3UP24 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nlrc4Q3UP24 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nlrc4Q3UP24 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Nlrc4Q3UP24 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Nlrc4Q3UP24 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nlrc4Q3UP24 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nlrc4Q3UP24 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nlrc4Q3UP24 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nlrc4Q3UP24 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nlrc4Q3UP24 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nlrc4Q3UP24 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nlrc4Q3UP24 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nlrc4Q3UP24 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nlrc4Q3UP24 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nlrc4Q3UP24 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nlrc4Q3UP24 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nlrc4Q3UP24 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nlrc4Q3UP24 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Nlrc4Q3UP24 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nlrc4Q3UP24 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nlrc4Q3UP24 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nlrc4Q3UP24 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nlrc4Q3UP24 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nlrc4Q3UP24 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Nlrc4Q3UP24 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Nlrc4Q3UP24 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nlrc4Q3UP24 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nlrc4Q3UP24 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nlrc4Q3UP24 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Nlrc4Q3UP24 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Nlrc4Q3UP24 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Nlrc4Q3UP24 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Nlrc4Q3UP24 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Nlrc4Q3UP24 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nlrc4Q3UP24 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nlrc4Q3UP24 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nlrc4Q3UP24 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nlrc4Q3UP24 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nlrc4Q3UP24 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nlrc4Q3UP24 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nlrc4Q3UP24 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nlrc4Q3UP24 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nlrc4Q3UP24 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nlrc4Q3UP24 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nlrc4Q3UP24 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nlrc4Q3UP24 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nlrc4Q3UP24 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nlrc4Q3UP24 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nlrc4Q3UP24 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nlrc4Q3UP24 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nlrc4Q3UP24 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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