Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q3U6N9 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Q3U6N9 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q3U6N9 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q3U6N9 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q3U6N9 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q3U6N9 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q3U6N9 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q3U6N9 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q3U6N9 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q3U6N9 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q3U6N9 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q3U6N9 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q3U6N9 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Q3U6N9 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Q3U6N9 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Q3U6N9 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q3U6N9 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Q3U6N9 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Q3U6N9 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q3U6N9 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q3U6N9 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q3U6N9 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q3U6N9 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q3U6N9 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q3U6N9 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q3U6N9 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q3U6N9 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q3U6N9 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q3U6N9 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q3U6N9 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q3U6N9 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q3U6N9 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q3U6N9 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q3U6N9 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q3U6N9 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q3U6N9 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q3U6N9 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q3U6N9 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q3U6N9 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q3U6N9 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q3U6N9 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q3U6N9 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q3U6N9 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q3U6N9 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q3U6N9 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q3U6N9 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q3U6N9 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q3U6N9 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q3U6N9 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Q3U6N9 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q3U6N9 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q3U6N9 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q3U6N9 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q3U6N9 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Q3U6N9 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Q3U6N9 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Q3U6N9 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Q3U6N9 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Q3U6N9 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Q3U6N9 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Q3U6N9 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Q3U6N9 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Q3U6N9 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Q3U6N9 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Q3U6N9 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Q3U6N9 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Q3U6N9 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Q3U6N9 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q3U6N9 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q3U6N9 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q3U6N9 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q3U6N9 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q3U6N9 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q3U6N9 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q3U6N9 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q3U6N9 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q3U6N9 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q3U6N9 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q3U6N9 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q3U6N9 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q3U6N9 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q3U6N9 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q3U6N9 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q3U6N9 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q3U6N9 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q3U6N9 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q3U6N9 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q3U6N9 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q3U6N9 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q3U6N9 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q3U6N9 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q3U6N9 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q3U6N9 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q3U6N9 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q3U6N9 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q3U6N9 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q3U6N9 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q3U6N9 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q3U6N9 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms