Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWW8

Srsf6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf6Q3TWW8 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Srsf6Q3TWW8 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Srsf6Q3TWW8 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Srsf6Q3TWW8 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Srsf6Q3TWW8 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Srsf6Q3TWW8 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Srsf6Q3TWW8 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Srsf6Q3TWW8 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Srsf6Q3TWW8 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Srsf6Q3TWW8 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Srsf6Q3TWW8 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Srsf6Q3TWW8 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Srsf6Q3TWW8 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Srsf6Q3TWW8 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Srsf6Q3TWW8 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Srsf6Q3TWW8 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Srsf6Q3TWW8 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Srsf6Q3TWW8 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Srsf6Q3TWW8 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Srsf6Q3TWW8 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Srsf6Q3TWW8 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Srsf6Q3TWW8 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Srsf6Q3TWW8 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Srsf6Q3TWW8 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Srsf6Q3TWW8 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Srsf6Q3TWW8 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Srsf6Q3TWW8 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Srsf6Q3TWW8 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Srsf6Q3TWW8 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Srsf6Q3TWW8 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Srsf6Q3TWW8 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Srsf6Q3TWW8 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Srsf6Q3TWW8 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Srsf6Q3TWW8 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Srsf6Q3TWW8 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Srsf6Q3TWW8 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Srsf6Q3TWW8 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Srsf6Q3TWW8 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Srsf6Q3TWW8 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Srsf6Q3TWW8 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Srsf6Q3TWW8 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Srsf6Q3TWW8 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Srsf6Q3TWW8 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Srsf6Q3TWW8 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Srsf6Q3TWW8 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Srsf6Q3TWW8 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Srsf6Q3TWW8 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Srsf6Q3TWW8 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Srsf6Q3TWW8 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Srsf6Q3TWW8 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Srsf6Q3TWW8 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Srsf6Q3TWW8 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Srsf6Q3TWW8 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Srsf6Q3TWW8 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Srsf6Q3TWW8 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Srsf6Q3TWW8 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Srsf6Q3TWW8 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Srsf6Q3TWW8 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Srsf6Q3TWW8 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Srsf6Q3TWW8 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Srsf6Q3TWW8 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Srsf6Q3TWW8 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Srsf6Q3TWW8 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Srsf6Q3TWW8 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Srsf6Q3TWW8 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Srsf6Q3TWW8 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Srsf6Q3TWW8 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Srsf6Q3TWW8 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Srsf6Q3TWW8 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Srsf6Q3TWW8 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Srsf6Q3TWW8 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Srsf6Q3TWW8 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Srsf6Q3TWW8 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Srsf6Q3TWW8 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Srsf6Q3TWW8 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Srsf6Q3TWW8 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Srsf6Q3TWW8 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Srsf6Q3TWW8 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Srsf6Q3TWW8 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Srsf6Q3TWW8 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Srsf6Q3TWW8 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Srsf6Q3TWW8 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Srsf6Q3TWW8 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Srsf6Q3TWW8 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Srsf6Q3TWW8 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Srsf6Q3TWW8 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Srsf6Q3TWW8 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Srsf6Q3TWW8 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Srsf6Q3TWW8 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Srsf6Q3TWW8 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Srsf6Q3TWW8 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Srsf6Q3TWW8 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Srsf6Q3TWW8 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Srsf6Q3TWW8 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Srsf6Q3TWW8 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Srsf6Q3TWW8 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Srsf6Q3TWW8 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Srsf6Q3TWW8 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Srsf6Q3TWW8 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Srsf6Q3TWW8 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
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