Protein–RNA interactions for Protein: Q1RLL3

Cpne9, Copine-9, mousemouse

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne9Q1RLL3 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cpne9Q1RLL3 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cpne9Q1RLL3 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cpne9Q1RLL3 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cpne9Q1RLL3 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cpne9Q1RLL3 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cpne9Q1RLL3 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cpne9Q1RLL3 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cpne9Q1RLL3 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cpne9Q1RLL3 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cpne9Q1RLL3 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cpne9Q1RLL3 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cpne9Q1RLL3 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cpne9Q1RLL3 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cpne9Q1RLL3 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cpne9Q1RLL3 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Cpne9Q1RLL3 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Cpne9Q1RLL3 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cpne9Q1RLL3 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cpne9Q1RLL3 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cpne9Q1RLL3 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Cpne9Q1RLL3 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cpne9Q1RLL3 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cpne9Q1RLL3 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cpne9Q1RLL3 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cpne9Q1RLL3 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cpne9Q1RLL3 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cpne9Q1RLL3 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cpne9Q1RLL3 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cpne9Q1RLL3 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cpne9Q1RLL3 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cpne9Q1RLL3 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cpne9Q1RLL3 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cpne9Q1RLL3 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cpne9Q1RLL3 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cpne9Q1RLL3 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cpne9Q1RLL3 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cpne9Q1RLL3 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cpne9Q1RLL3 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cpne9Q1RLL3 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cpne9Q1RLL3 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cpne9Q1RLL3 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cpne9Q1RLL3 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cpne9Q1RLL3 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cpne9Q1RLL3 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cpne9Q1RLL3 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cpne9Q1RLL3 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cpne9Q1RLL3 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cpne9Q1RLL3 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cpne9Q1RLL3 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Cpne9Q1RLL3 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cpne9Q1RLL3 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cpne9Q1RLL3 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cpne9Q1RLL3 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cpne9Q1RLL3 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cpne9Q1RLL3 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cpne9Q1RLL3 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cpne9Q1RLL3 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cpne9Q1RLL3 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cpne9Q1RLL3 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cpne9Q1RLL3 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cpne9Q1RLL3 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cpne9Q1RLL3 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cpne9Q1RLL3 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cpne9Q1RLL3 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cpne9Q1RLL3 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cpne9Q1RLL3 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cpne9Q1RLL3 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cpne9Q1RLL3 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cpne9Q1RLL3 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cpne9Q1RLL3 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cpne9Q1RLL3 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cpne9Q1RLL3 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cpne9Q1RLL3 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cpne9Q1RLL3 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cpne9Q1RLL3 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cpne9Q1RLL3 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Cpne9Q1RLL3 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Cpne9Q1RLL3 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cpne9Q1RLL3 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Cpne9Q1RLL3 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cpne9Q1RLL3 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cpne9Q1RLL3 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cpne9Q1RLL3 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cpne9Q1RLL3 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cpne9Q1RLL3 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cpne9Q1RLL3 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cpne9Q1RLL3 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Cpne9Q1RLL3 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cpne9Q1RLL3 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cpne9Q1RLL3 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cpne9Q1RLL3 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cpne9Q1RLL3 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cpne9Q1RLL3 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cpne9Q1RLL3 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cpne9Q1RLL3 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cpne9Q1RLL3 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cpne9Q1RLL3 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Cpne9Q1RLL3 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cpne9Q1RLL3 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
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