Protein–RNA interactions for Protein: Q14AI6

Rpusd3, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase Rpusd3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd3Q14AI6 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rpusd3Q14AI6 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
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Rpusd3Q14AI6 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rpusd3Q14AI6 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Rpusd3Q14AI6 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Rpusd3Q14AI6 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Rpusd3Q14AI6 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Rpusd3Q14AI6 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
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Rpusd3Q14AI6 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rpusd3Q14AI6 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rpusd3Q14AI6 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rpusd3Q14AI6 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rpusd3Q14AI6 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rpusd3Q14AI6 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rpusd3Q14AI6 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rpusd3Q14AI6 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Rpusd3Q14AI6 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rpusd3Q14AI6 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Rpusd3Q14AI6 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Rpusd3Q14AI6 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rpusd3Q14AI6 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rpusd3Q14AI6 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rpusd3Q14AI6 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
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Rpusd3Q14AI6 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
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Rpusd3Q14AI6 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
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Rpusd3Q14AI6 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Rpusd3Q14AI6 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rpusd3Q14AI6 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rpusd3Q14AI6 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rpusd3Q14AI6 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Rpusd3Q14AI6 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Rpusd3Q14AI6 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rpusd3Q14AI6 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rpusd3Q14AI6 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rpusd3Q14AI6 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rpusd3Q14AI6 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Rpusd3Q14AI6 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rpusd3Q14AI6 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rpusd3Q14AI6 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rpusd3Q14AI6 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rpusd3Q14AI6 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Rpusd3Q14AI6 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rpusd3Q14AI6 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Rpusd3Q14AI6 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rpusd3Q14AI6 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rpusd3Q14AI6 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rpusd3Q14AI6 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rpusd3Q14AI6 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rpusd3Q14AI6 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rpusd3Q14AI6 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Rpusd3Q14AI6 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rpusd3Q14AI6 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rpusd3Q14AI6 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rpusd3Q14AI6 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rpusd3Q14AI6 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rpusd3Q14AI6 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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