Protein–RNA interactions for Protein: Q0MW30

Neurl1b, E3 ubiquitin-protein ligase NEURL1B, mousemouse

Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurl1bQ0MW30 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Neurl1bQ0MW30 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Neurl1bQ0MW30 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Neurl1bQ0MW30 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Neurl1bQ0MW30 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Neurl1bQ0MW30 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Neurl1bQ0MW30 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Neurl1bQ0MW30 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Neurl1bQ0MW30 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Neurl1bQ0MW30 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Neurl1bQ0MW30 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Neurl1bQ0MW30 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Neurl1bQ0MW30 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Neurl1bQ0MW30 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Neurl1bQ0MW30 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Neurl1bQ0MW30 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Neurl1bQ0MW30 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Neurl1bQ0MW30 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Neurl1bQ0MW30 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Neurl1bQ0MW30 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Neurl1bQ0MW30 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Neurl1bQ0MW30 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Neurl1bQ0MW30 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Neurl1bQ0MW30 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Neurl1bQ0MW30 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Neurl1bQ0MW30 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Neurl1bQ0MW30 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Neurl1bQ0MW30 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Neurl1bQ0MW30 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Neurl1bQ0MW30 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Neurl1bQ0MW30 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Neurl1bQ0MW30 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Neurl1bQ0MW30 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Neurl1bQ0MW30 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Neurl1bQ0MW30 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Neurl1bQ0MW30 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Neurl1bQ0MW30 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Neurl1bQ0MW30 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Neurl1bQ0MW30 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Neurl1bQ0MW30 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Neurl1bQ0MW30 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Neurl1bQ0MW30 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Neurl1bQ0MW30 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Neurl1bQ0MW30 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Neurl1bQ0MW30 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Neurl1bQ0MW30 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Neurl1bQ0MW30 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Neurl1bQ0MW30 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Neurl1bQ0MW30 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Neurl1bQ0MW30 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Neurl1bQ0MW30 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Neurl1bQ0MW30 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Neurl1bQ0MW30 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Neurl1bQ0MW30 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Neurl1bQ0MW30 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Neurl1bQ0MW30 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Neurl1bQ0MW30 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Neurl1bQ0MW30 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Neurl1bQ0MW30 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Neurl1bQ0MW30 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Neurl1bQ0MW30 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Neurl1bQ0MW30 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Neurl1bQ0MW30 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Neurl1bQ0MW30 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Neurl1bQ0MW30 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Neurl1bQ0MW30 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Neurl1bQ0MW30 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Neurl1bQ0MW30 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Neurl1bQ0MW30 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Neurl1bQ0MW30 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Neurl1bQ0MW30 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Neurl1bQ0MW30 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Neurl1bQ0MW30 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Neurl1bQ0MW30 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Neurl1bQ0MW30 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Neurl1bQ0MW30 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Neurl1bQ0MW30 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Neurl1bQ0MW30 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Neurl1bQ0MW30 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Neurl1bQ0MW30 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Neurl1bQ0MW30 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Neurl1bQ0MW30 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Neurl1bQ0MW30 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Neurl1bQ0MW30 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Neurl1bQ0MW30 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Neurl1bQ0MW30 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Neurl1bQ0MW30 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Neurl1bQ0MW30 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Neurl1bQ0MW30 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Neurl1bQ0MW30 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Neurl1bQ0MW30 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Neurl1bQ0MW30 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Neurl1bQ0MW30 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Neurl1bQ0MW30 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Neurl1bQ0MW30 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Neurl1bQ0MW30 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Neurl1bQ0MW30 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Neurl1bQ0MW30 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Neurl1bQ0MW30 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Neurl1bQ0MW30 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80 ms