Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sox12Q04890 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sox12Q04890 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sox12Q04890 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sox12Q04890 Milr1-202ENSMUST00000106794 1514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sox12Q04890 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sox12Q04890 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sox12Q04890 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sox12Q04890 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sox12Q04890 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sox12Q04890 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sox12Q04890 Gm20917-202ENSMUST00000188706 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sox12Q04890 Gm21394-202ENSMUST00000189463 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sox12Q04890 Gm20806-202ENSMUST00000190349 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sox12Q04890 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sox12Q04890 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sox12Q04890 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sox12Q04890 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sox12Q04890 Krtap13-201ENSMUST00000053149 882 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sox12Q04890 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sox12Q04890 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sox12Q04890 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sox12Q04890 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sox12Q04890 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sox12Q04890 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Sox12Q04890 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sox12Q04890 AC140393.3-201ENSMUST00000228396 1352 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Sox12Q04890 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Sox12Q04890 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Sox12Q04890 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Sox12Q04890 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Sox12Q04890 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Sox12Q04890 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Sox12Q04890 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Sox12Q04890 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sox12Q04890 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sox12Q04890 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sox12Q04890 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sox12Q04890 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sox12Q04890 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sox12Q04890 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sox12Q04890 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sox12Q04890 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sox12Q04890 Pigp-201ENSMUST00000113905 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sox12Q04890 Gm13183-201ENSMUST00000118615 789 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Sox12Q04890 Gm13924-201ENSMUST00000119899 486 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Sox12Q04890 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sox12Q04890 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sox12Q04890 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sox12Q04890 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sox12Q04890 Gm42696-201ENSMUST00000199859 1142 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Sox12Q04890 Olfr1295-201ENSMUST00000207283 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sox12Q04890 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sox12Q04890 AC132237.2-201ENSMUST00000221702 1209 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Sox12Q04890 AC154484.1-201ENSMUST00000227311 771 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Sox12Q04890 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Sox12Q04890 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sox12Q04890 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sox12Q04890 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sox12Q04890 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sox12Q04890 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sox12Q04890 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sox12Q04890 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sox12Q04890 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sox12Q04890 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sox12Q04890 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sox12Q04890 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sox12Q04890 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sox12Q04890 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sox12Q04890 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sox12Q04890 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Sox12Q04890 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sox12Q04890 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sox12Q04890 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sox12Q04890 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sox12Q04890 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Sox12Q04890 Defa-ps4-201ENSMUST00000118021 183 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Sox12Q04890 Gm11835-201ENSMUST00000120635 663 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Sox12Q04890 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Sox12Q04890 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Sox12Q04890 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Sox12Q04890 Olfr863-ps1-201ENSMUST00000213073 929 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Sox12Q04890 AC165256.1-201ENSMUST00000216687 670 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Sox12Q04890 AC124687.2-201ENSMUST00000221927 1228 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Sox12Q04890 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sox12Q04890 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Sox12Q04890 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sox12Q04890 Pate4-201ENSMUST00000034610 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sox12Q04890 Prl8a9-201ENSMUST00000006662 942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sox12Q04890 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Sox12Q04890 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Sox12Q04890 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sox12Q04890 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sox12Q04890 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sox12Q04890 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sox12Q04890 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sox12Q04890 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sox12Q04890 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Sox12Q04890 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Sox12Q04890 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms