Protein–RNA interactions for Protein: P97769

Cited1, Cbp/p300-interacting transactivator 1, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cited1P97769 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cited1P97769 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cited1P97769 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cited1P97769 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cited1P97769 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cited1P97769 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cited1P97769 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cited1P97769 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cited1P97769 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cited1P97769 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cited1P97769 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cited1P97769 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cited1P97769 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cited1P97769 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cited1P97769 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Cited1P97769 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cited1P97769 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cited1P97769 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cited1P97769 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cited1P97769 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cited1P97769 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cited1P97769 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cited1P97769 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cited1P97769 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cited1P97769 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cited1P97769 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cited1P97769 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cited1P97769 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cited1P97769 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cited1P97769 Slc38a3-203ENSMUST00000177567 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cited1P97769 Slc38a3-209ENSMUST00000193932 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cited1P97769 Prf1-202ENSMUST00000219375 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cited1P97769 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cited1P97769 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cited1P97769 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cited1P97769 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cited1P97769 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cited1P97769 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cited1P97769 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Cited1P97769 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cited1P97769 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cited1P97769 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cited1P97769 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cited1P97769 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cited1P97769 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cited1P97769 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cited1P97769 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cited1P97769 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Cited1P97769 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cited1P97769 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cited1P97769 Olfr1490-202ENSMUST00000213900 5165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cited1P97769 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cited1P97769 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cited1P97769 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cited1P97769 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cited1P97769 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cited1P97769 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cited1P97769 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cited1P97769 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cited1P97769 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cited1P97769 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cited1P97769 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Cited1P97769 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cited1P97769 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cited1P97769 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cited1P97769 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cited1P97769 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Cited1P97769 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Cited1P97769 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cited1P97769 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cited1P97769 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cited1P97769 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cited1P97769 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cited1P97769 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cited1P97769 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cited1P97769 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cited1P97769 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cited1P97769 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cited1P97769 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Cited1P97769 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cited1P97769 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cited1P97769 Ccdc63-201ENSMUST00000058960 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cited1P97769 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cited1P97769 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cited1P97769 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cited1P97769 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cited1P97769 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cited1P97769 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cited1P97769 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cited1P97769 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cited1P97769 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cited1P97769 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cited1P97769 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cited1P97769 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cited1P97769 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cited1P97769 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cited1P97769 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cited1P97769 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cited1P97769 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cited1P97769 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms