Protein–RNA interactions for Protein: P97452

Bop1, Ribosome biogenesis protein BOP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 732 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bop1P97452 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Bop1P97452 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Bop1P97452 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Bop1P97452 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Bop1P97452 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Bop1P97452 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Bop1P97452 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Bop1P97452 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Bop1P97452 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Bop1P97452 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Bop1P97452 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Bop1P97452 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Bop1P97452 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Bop1P97452 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Bop1P97452 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Bop1P97452 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Bop1P97452 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Bop1P97452 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Bop1P97452 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Bop1P97452 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Bop1P97452 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Bop1P97452 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Bop1P97452 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Bop1P97452 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Bop1P97452 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Bop1P97452 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Bop1P97452 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Bop1P97452 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Bop1P97452 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Bop1P97452 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Bop1P97452 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Bop1P97452 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Bop1P97452 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Bop1P97452 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Bop1P97452 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Bop1P97452 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Bop1P97452 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Bop1P97452 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Bop1P97452 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Bop1P97452 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Bop1P97452 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Bop1P97452 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Bop1P97452 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Bop1P97452 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Bop1P97452 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Bop1P97452 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Bop1P97452 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Bop1P97452 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Bop1P97452 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Bop1P97452 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Bop1P97452 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Bop1P97452 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Bop1P97452 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Bop1P97452 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Bop1P97452 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Bop1P97452 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Bop1P97452 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Bop1P97452 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Bop1P97452 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Bop1P97452 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Bop1P97452 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Bop1P97452 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Bop1P97452 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Bop1P97452 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Bop1P97452 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Bop1P97452 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Bop1P97452 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Bop1P97452 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Bop1P97452 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Bop1P97452 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Bop1P97452 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Bop1P97452 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Bop1P97452 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Bop1P97452 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Bop1P97452 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Bop1P97452 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Bop1P97452 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Bop1P97452 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Bop1P97452 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Bop1P97452 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Bop1P97452 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Bop1P97452 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Bop1P97452 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Bop1P97452 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Bop1P97452 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Bop1P97452 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Bop1P97452 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Bop1P97452 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Bop1P97452 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Bop1P97452 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Bop1P97452 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Bop1P97452 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Bop1P97452 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Bop1P97452 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Bop1P97452 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Bop1P97452 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Bop1P97452 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Bop1P97452 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Bop1P97452 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Bop1P97452 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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