Protein–RNA interactions for Protein: P81066

Irx2, Iroquois-class homeodomain protein IRX-2, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx2P81066 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Irx2P81066 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Irx2P81066 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Irx2P81066 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Irx2P81066 Gm10686-201ENSMUST00000215389 3247 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Irx2P81066 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Irx2P81066 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Irx2P81066 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Irx2P81066 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Irx2P81066 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Irx2P81066 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Irx2P81066 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Irx2P81066 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Irx2P81066 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Irx2P81066 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Irx2P81066 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Irx2P81066 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Irx2P81066 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Irx2P81066 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Irx2P81066 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Irx2P81066 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Irx2P81066 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Irx2P81066 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Irx2P81066 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Irx2P81066 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Irx2P81066 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Irx2P81066 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Irx2P81066 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Irx2P81066 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Irx2P81066 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Irx2P81066 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Irx2P81066 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Irx2P81066 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Irx2P81066 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Irx2P81066 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Irx2P81066 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Irx2P81066 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Irx2P81066 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Irx2P81066 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Irx2P81066 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Irx2P81066 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Irx2P81066 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Irx2P81066 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Irx2P81066 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Irx2P81066 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Irx2P81066 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Irx2P81066 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Irx2P81066 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Irx2P81066 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Irx2P81066 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Irx2P81066 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Irx2P81066 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Irx2P81066 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Irx2P81066 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Irx2P81066 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Irx2P81066 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Irx2P81066 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Irx2P81066 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Irx2P81066 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Irx2P81066 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Irx2P81066 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Irx2P81066 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Irx2P81066 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Irx2P81066 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Irx2P81066 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Irx2P81066 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Irx2P81066 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Irx2P81066 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Irx2P81066 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Irx2P81066 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Irx2P81066 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Irx2P81066 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Irx2P81066 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Irx2P81066 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Irx2P81066 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Irx2P81066 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Irx2P81066 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Irx2P81066 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Irx2P81066 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Irx2P81066 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Irx2P81066 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Irx2P81066 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Irx2P81066 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Irx2P81066 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Irx2P81066 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Irx2P81066 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Irx2P81066 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Irx2P81066 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Irx2P81066 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Irx2P81066 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Irx2P81066 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Irx2P81066 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Irx2P81066 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Irx2P81066 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Irx2P81066 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Irx2P81066 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Irx2P81066 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Irx2P81066 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Irx2P81066 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Irx2P81066 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms