Protein–RNA interactions for Protein: P80205

Otx1, Homeobox protein OTX1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx1P80205 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Otx1P80205 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Otx1P80205 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Otx1P80205 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Otx1P80205 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Otx1P80205 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Otx1P80205 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Otx1P80205 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Otx1P80205 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Otx1P80205 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Otx1P80205 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Otx1P80205 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Otx1P80205 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Otx1P80205 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Otx1P80205 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Otx1P80205 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Otx1P80205 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Otx1P80205 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Otx1P80205 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Otx1P80205 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Otx1P80205 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Otx1P80205 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Otx1P80205 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Otx1P80205 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Otx1P80205 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Otx1P80205 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Otx1P80205 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Otx1P80205 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Otx1P80205 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Otx1P80205 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Otx1P80205 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Otx1P80205 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Otx1P80205 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Otx1P80205 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Otx1P80205 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Otx1P80205 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Otx1P80205 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Otx1P80205 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Otx1P80205 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Otx1P80205 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Otx1P80205 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Otx1P80205 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Otx1P80205 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Otx1P80205 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Otx1P80205 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Otx1P80205 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Otx1P80205 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Otx1P80205 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Otx1P80205 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Otx1P80205 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Otx1P80205 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Otx1P80205 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Otx1P80205 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Otx1P80205 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Otx1P80205 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Otx1P80205 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Otx1P80205 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Otx1P80205 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Otx1P80205 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Otx1P80205 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Otx1P80205 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Otx1P80205 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Otx1P80205 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Otx1P80205 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Otx1P80205 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Otx1P80205 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Otx1P80205 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Otx1P80205 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Otx1P80205 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Otx1P80205 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Otx1P80205 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Otx1P80205 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Otx1P80205 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Otx1P80205 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Otx1P80205 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Otx1P80205 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Otx1P80205 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Otx1P80205 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Otx1P80205 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Otx1P80205 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Otx1P80205 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Otx1P80205 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Otx1P80205 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Otx1P80205 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Otx1P80205 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Otx1P80205 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Otx1P80205 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Otx1P80205 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Otx1P80205 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Otx1P80205 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Otx1P80205 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Otx1P80205 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Otx1P80205 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Otx1P80205 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Otx1P80205 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Otx1P80205 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Otx1P80205 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Otx1P80205 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Otx1P80205 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Otx1P80205 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms