Protein–RNA interactions for Protein: P70338

Gfi1, Zinc finger protein Gfi-1, mousemouse

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Length 423 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfi1P70338 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Gfi1P70338 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gfi1P70338 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gfi1P70338 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Gfi1P70338 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Gfi1P70338 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Gfi1P70338 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Gfi1P70338 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Gfi1P70338 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gfi1P70338 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gfi1P70338 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gfi1P70338 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gfi1P70338 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Gfi1P70338 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gfi1P70338 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gfi1P70338 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gfi1P70338 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Gfi1P70338 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gfi1P70338 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gfi1P70338 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Gfi1P70338 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gfi1P70338 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gfi1P70338 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Gfi1P70338 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gfi1P70338 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gfi1P70338 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gfi1P70338 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gfi1P70338 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gfi1P70338 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gfi1P70338 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gfi1P70338 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gfi1P70338 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gfi1P70338 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gfi1P70338 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gfi1P70338 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Gfi1P70338 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gfi1P70338 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gfi1P70338 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gfi1P70338 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Gfi1P70338 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gfi1P70338 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Gfi1P70338 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gfi1P70338 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
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Gfi1P70338 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gfi1P70338 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gfi1P70338 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Gfi1P70338 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gfi1P70338 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gfi1P70338 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gfi1P70338 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gfi1P70338 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gfi1P70338 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Gfi1P70338 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gfi1P70338 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gfi1P70338 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Gfi1P70338 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gfi1P70338 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gfi1P70338 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gfi1P70338 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gfi1P70338 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gfi1P70338 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gfi1P70338 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gfi1P70338 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gfi1P70338 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gfi1P70338 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gfi1P70338 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gfi1P70338 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gfi1P70338 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gfi1P70338 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gfi1P70338 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gfi1P70338 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gfi1P70338 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gfi1P70338 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gfi1P70338 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gfi1P70338 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Gfi1P70338 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gfi1P70338 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gfi1P70338 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gfi1P70338 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gfi1P70338 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gfi1P70338 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gfi1P70338 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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