Protein–RNA interactions for Protein: P70298

Cux2, Homeobox protein cut-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cux2P70298 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Cux2P70298 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Cux2P70298 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cux2P70298 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cux2P70298 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cux2P70298 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Cux2P70298 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cux2P70298 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cux2P70298 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Cux2P70298 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cux2P70298 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Cux2P70298 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cux2P70298 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cux2P70298 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Cux2P70298 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cux2P70298 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cux2P70298 Tmed5-203ENSMUST00000117759 482 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cux2P70298 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cux2P70298 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cux2P70298 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cux2P70298 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cux2P70298 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cux2P70298 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cux2P70298 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Cux2P70298 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cux2P70298 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cux2P70298 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cux2P70298 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cux2P70298 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cux2P70298 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cux2P70298 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cux2P70298 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cux2P70298 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cux2P70298 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cux2P70298 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cux2P70298 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cux2P70298 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cux2P70298 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cux2P70298 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cux2P70298 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Cux2P70298 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cux2P70298 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cux2P70298 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Cux2P70298 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cux2P70298 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Cux2P70298 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cux2P70298 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cux2P70298 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cux2P70298 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cux2P70298 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cux2P70298 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cux2P70298 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cux2P70298 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cux2P70298 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cux2P70298 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Cux2P70298 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cux2P70298 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Cux2P70298 Gm44551-201ENSMUST00000208804 171 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Cux2P70298 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cux2P70298 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cux2P70298 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Cux2P70298 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cux2P70298 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cux2P70298 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cux2P70298 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cux2P70298 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cux2P70298 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cux2P70298 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cux2P70298 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cux2P70298 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cux2P70298 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cux2P70298 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cux2P70298 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Cux2P70298 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cux2P70298 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Cux2P70298 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Cux2P70298 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Cux2P70298 Hrc-202ENSMUST00000211327 607 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cux2P70298 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cux2P70298 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cux2P70298 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cux2P70298 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cux2P70298 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cux2P70298 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cux2P70298 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cux2P70298 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cux2P70298 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cux2P70298 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cux2P70298 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cux2P70298 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cux2P70298 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cux2P70298 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cux2P70298 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cux2P70298 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cux2P70298 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cux2P70298 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cux2P70298 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cux2P70298 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cux2P70298 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cux2P70298 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms