Protein–RNA interactions for Protein: P70255

Nfic, Nuclear factor 1 C-type, mousemouse

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Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NficP70255 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NficP70255 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NficP70255 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NficP70255 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NficP70255 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
NficP70255 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NficP70255 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NficP70255 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NficP70255 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NficP70255 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NficP70255 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NficP70255 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NficP70255 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NficP70255 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NficP70255 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NficP70255 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NficP70255 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
NficP70255 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
NficP70255 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
NficP70255 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NficP70255 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NficP70255 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NficP70255 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NficP70255 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NficP70255 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NficP70255 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NficP70255 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NficP70255 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NficP70255 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NficP70255 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NficP70255 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
NficP70255 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
NficP70255 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
NficP70255 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
NficP70255 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
NficP70255 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NficP70255 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NficP70255 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NficP70255 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NficP70255 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NficP70255 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NficP70255 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NficP70255 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NficP70255 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NficP70255 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NficP70255 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NficP70255 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NficP70255 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NficP70255 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NficP70255 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NficP70255 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NficP70255 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NficP70255 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NficP70255 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NficP70255 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NficP70255 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NficP70255 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NficP70255 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NficP70255 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NficP70255 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NficP70255 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NficP70255 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NficP70255 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NficP70255 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NficP70255 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NficP70255 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NficP70255 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NficP70255 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NficP70255 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NficP70255 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NficP70255 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NficP70255 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NficP70255 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
NficP70255 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NficP70255 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NficP70255 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NficP70255 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NficP70255 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NficP70255 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NficP70255 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
NficP70255 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
NficP70255 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
NficP70255 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NficP70255 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NficP70255 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NficP70255 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NficP70255 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NficP70255 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NficP70255 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NficP70255 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NficP70255 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NficP70255 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NficP70255 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NficP70255 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NficP70255 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NficP70255 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NficP70255 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NficP70255 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NficP70255 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NficP70255 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
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