Protein–RNA interactions for Protein: P60879

Snap25, Synaptosomal-associated protein 25, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap25P60879 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Snap25P60879 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Snap25P60879 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Snap25P60879 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Snap25P60879 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Snap25P60879 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Snap25P60879 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Snap25P60879 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snap25P60879 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snap25P60879 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snap25P60879 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snap25P60879 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snap25P60879 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snap25P60879 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snap25P60879 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snap25P60879 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snap25P60879 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snap25P60879 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snap25P60879 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snap25P60879 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Snap25P60879 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snap25P60879 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snap25P60879 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Snap25P60879 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snap25P60879 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snap25P60879 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snap25P60879 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snap25P60879 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Snap25P60879 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snap25P60879 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snap25P60879 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snap25P60879 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snap25P60879 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snap25P60879 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snap25P60879 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snap25P60879 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snap25P60879 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snap25P60879 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Snap25P60879 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snap25P60879 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snap25P60879 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snap25P60879 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snap25P60879 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snap25P60879 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snap25P60879 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snap25P60879 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snap25P60879 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snap25P60879 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snap25P60879 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snap25P60879 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snap25P60879 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snap25P60879 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snap25P60879 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snap25P60879 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snap25P60879 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snap25P60879 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snap25P60879 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snap25P60879 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snap25P60879 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snap25P60879 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snap25P60879 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snap25P60879 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snap25P60879 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snap25P60879 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snap25P60879 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snap25P60879 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snap25P60879 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Snap25P60879 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snap25P60879 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snap25P60879 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snap25P60879 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snap25P60879 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snap25P60879 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snap25P60879 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snap25P60879 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snap25P60879 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snap25P60879 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snap25P60879 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snap25P60879 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snap25P60879 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snap25P60879 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snap25P60879 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snap25P60879 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snap25P60879 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snap25P60879 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snap25P60879 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snap25P60879 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snap25P60879 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snap25P60879 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snap25P60879 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snap25P60879 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snap25P60879 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snap25P60879 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snap25P60879 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Snap25P60879 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snap25P60879 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snap25P60879 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Snap25P60879 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snap25P60879 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Snap25P60879 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms