Protein–RNA interactions for Protein: P60335

Pcbp1, Poly(rC)-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcbp1P60335 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pcbp1P60335 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Pcbp1P60335 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pcbp1P60335 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pcbp1P60335 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pcbp1P60335 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pcbp1P60335 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pcbp1P60335 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pcbp1P60335 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pcbp1P60335 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pcbp1P60335 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pcbp1P60335 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pcbp1P60335 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pcbp1P60335 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pcbp1P60335 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pcbp1P60335 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pcbp1P60335 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pcbp1P60335 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Pcbp1P60335 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Pcbp1P60335 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pcbp1P60335 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Pcbp1P60335 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pcbp1P60335 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Pcbp1P60335 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pcbp1P60335 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pcbp1P60335 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pcbp1P60335 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pcbp1P60335 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pcbp1P60335 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pcbp1P60335 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pcbp1P60335 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Pcbp1P60335 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pcbp1P60335 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pcbp1P60335 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pcbp1P60335 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pcbp1P60335 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pcbp1P60335 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pcbp1P60335 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pcbp1P60335 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Pcbp1P60335 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pcbp1P60335 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pcbp1P60335 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pcbp1P60335 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pcbp1P60335 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pcbp1P60335 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Pcbp1P60335 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pcbp1P60335 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pcbp1P60335 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pcbp1P60335 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pcbp1P60335 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pcbp1P60335 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pcbp1P60335 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pcbp1P60335 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pcbp1P60335 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pcbp1P60335 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Pcbp1P60335 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pcbp1P60335 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Pcbp1P60335 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Pcbp1P60335 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pcbp1P60335 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pcbp1P60335 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pcbp1P60335 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pcbp1P60335 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pcbp1P60335 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pcbp1P60335 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pcbp1P60335 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pcbp1P60335 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pcbp1P60335 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pcbp1P60335 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pcbp1P60335 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pcbp1P60335 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pcbp1P60335 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pcbp1P60335 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pcbp1P60335 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pcbp1P60335 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pcbp1P60335 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pcbp1P60335 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pcbp1P60335 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pcbp1P60335 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pcbp1P60335 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pcbp1P60335 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pcbp1P60335 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pcbp1P60335 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pcbp1P60335 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pcbp1P60335 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pcbp1P60335 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pcbp1P60335 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Pcbp1P60335 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Pcbp1P60335 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pcbp1P60335 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pcbp1P60335 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pcbp1P60335 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pcbp1P60335 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pcbp1P60335 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pcbp1P60335 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Pcbp1P60335 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pcbp1P60335 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pcbp1P60335 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pcbp1P60335 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Pcbp1P60335 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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