Protein–RNA interactions for Protein: P58873

Rhbdl3, Rhomboid-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhbdl3P58873 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rhbdl3P58873 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Rhbdl3P58873 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rhbdl3P58873 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rhbdl3P58873 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rhbdl3P58873 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rhbdl3P58873 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rhbdl3P58873 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rhbdl3P58873 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Rhbdl3P58873 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rhbdl3P58873 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rhbdl3P58873 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rhbdl3P58873 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rhbdl3P58873 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rhbdl3P58873 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rhbdl3P58873 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rhbdl3P58873 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rhbdl3P58873 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rhbdl3P58873 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rhbdl3P58873 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rhbdl3P58873 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rhbdl3P58873 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rhbdl3P58873 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rhbdl3P58873 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rhbdl3P58873 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rhbdl3P58873 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rhbdl3P58873 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Rhbdl3P58873 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rhbdl3P58873 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Rhbdl3P58873 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rhbdl3P58873 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rhbdl3P58873 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rhbdl3P58873 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rhbdl3P58873 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rhbdl3P58873 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rhbdl3P58873 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rhbdl3P58873 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rhbdl3P58873 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Rhbdl3P58873 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Rhbdl3P58873 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rhbdl3P58873 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rhbdl3P58873 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rhbdl3P58873 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rhbdl3P58873 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rhbdl3P58873 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rhbdl3P58873 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rhbdl3P58873 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rhbdl3P58873 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rhbdl3P58873 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Rhbdl3P58873 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rhbdl3P58873 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rhbdl3P58873 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rhbdl3P58873 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rhbdl3P58873 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rhbdl3P58873 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rhbdl3P58873 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rhbdl3P58873 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rhbdl3P58873 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rhbdl3P58873 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rhbdl3P58873 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Rhbdl3P58873 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rhbdl3P58873 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rhbdl3P58873 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rhbdl3P58873 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rhbdl3P58873 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rhbdl3P58873 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rhbdl3P58873 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rhbdl3P58873 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rhbdl3P58873 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rhbdl3P58873 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rhbdl3P58873 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rhbdl3P58873 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rhbdl3P58873 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rhbdl3P58873 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rhbdl3P58873 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rhbdl3P58873 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rhbdl3P58873 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rhbdl3P58873 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rhbdl3P58873 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rhbdl3P58873 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rhbdl3P58873 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rhbdl3P58873 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Rhbdl3P58873 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rhbdl3P58873 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rhbdl3P58873 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rhbdl3P58873 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rhbdl3P58873 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rhbdl3P58873 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rhbdl3P58873 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rhbdl3P58873 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rhbdl3P58873 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Rhbdl3P58873 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rhbdl3P58873 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rhbdl3P58873 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rhbdl3P58873 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Rhbdl3P58873 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Rhbdl3P58873 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rhbdl3P58873 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rhbdl3P58873 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rhbdl3P58873 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms