Protein–RNA interactions for Protein: P58774

Tpm2, Tropomyosin beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm2P58774 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tpm2P58774 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tpm2P58774 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tpm2P58774 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tpm2P58774 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tpm2P58774 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tpm2P58774 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tpm2P58774 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tpm2P58774 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tpm2P58774 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tpm2P58774 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Tpm2P58774 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tpm2P58774 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tpm2P58774 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tpm2P58774 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tpm2P58774 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tpm2P58774 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tpm2P58774 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tpm2P58774 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tpm2P58774 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tpm2P58774 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tpm2P58774 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tpm2P58774 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tpm2P58774 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tpm2P58774 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tpm2P58774 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tpm2P58774 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tpm2P58774 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tpm2P58774 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tpm2P58774 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tpm2P58774 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tpm2P58774 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tpm2P58774 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tpm2P58774 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tpm2P58774 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tpm2P58774 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tpm2P58774 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tpm2P58774 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tpm2P58774 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tpm2P58774 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tpm2P58774 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tpm2P58774 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tpm2P58774 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tpm2P58774 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tpm2P58774 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tpm2P58774 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tpm2P58774 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tpm2P58774 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tpm2P58774 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Tpm2P58774 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tpm2P58774 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tpm2P58774 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Tpm2P58774 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tpm2P58774 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Tpm2P58774 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tpm2P58774 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tpm2P58774 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tpm2P58774 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tpm2P58774 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tpm2P58774 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tpm2P58774 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tpm2P58774 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tpm2P58774 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tpm2P58774 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tpm2P58774 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tpm2P58774 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tpm2P58774 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tpm2P58774 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tpm2P58774 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tpm2P58774 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tpm2P58774 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tpm2P58774 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tpm2P58774 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tpm2P58774 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tpm2P58774 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tpm2P58774 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tpm2P58774 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tpm2P58774 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tpm2P58774 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Tpm2P58774 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tpm2P58774 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Tpm2P58774 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tpm2P58774 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tpm2P58774 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tpm2P58774 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tpm2P58774 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tpm2P58774 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tpm2P58774 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tpm2P58774 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tpm2P58774 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tpm2P58774 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tpm2P58774 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tpm2P58774 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tpm2P58774 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tpm2P58774 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tpm2P58774 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tpm2P58774 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tpm2P58774 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tpm2P58774 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tpm2P58774 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.1 ms