Protein–RNA interactions for Protein: P56857

Cldn18, Claudin-18, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn18P56857 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn18P56857 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn18P56857 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn18P56857 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn18P56857 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn18P56857 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn18P56857 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn18P56857 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn18P56857 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn18P56857 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn18P56857 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn18P56857 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn18P56857 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn18P56857 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn18P56857 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn18P56857 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn18P56857 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn18P56857 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn18P56857 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cldn18P56857 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cldn18P56857 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cldn18P56857 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cldn18P56857 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cldn18P56857 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cldn18P56857 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cldn18P56857 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cldn18P56857 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cldn18P56857 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cldn18P56857 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cldn18P56857 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cldn18P56857 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Cldn18P56857 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cldn18P56857 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cldn18P56857 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cldn18P56857 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cldn18P56857 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cldn18P56857 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cldn18P56857 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cldn18P56857 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cldn18P56857 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cldn18P56857 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cldn18P56857 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cldn18P56857 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cldn18P56857 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cldn18P56857 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cldn18P56857 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cldn18P56857 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cldn18P56857 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cldn18P56857 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cldn18P56857 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cldn18P56857 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cldn18P56857 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cldn18P56857 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cldn18P56857 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cldn18P56857 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cldn18P56857 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cldn18P56857 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cldn18P56857 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cldn18P56857 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cldn18P56857 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cldn18P56857 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cldn18P56857 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cldn18P56857 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Cldn18P56857 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cldn18P56857 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cldn18P56857 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cldn18P56857 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cldn18P56857 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cldn18P56857 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cldn18P56857 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Cldn18P56857 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cldn18P56857 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cldn18P56857 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cldn18P56857 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Cldn18P56857 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cldn18P56857 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cldn18P56857 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cldn18P56857 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cldn18P56857 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cldn18P56857 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cldn18P56857 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cldn18P56857 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cldn18P56857 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cldn18P56857 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cldn18P56857 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cldn18P56857 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cldn18P56857 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cldn18P56857 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cldn18P56857 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cldn18P56857 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cldn18P56857 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cldn18P56857 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cldn18P56857 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cldn18P56857 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cldn18P56857 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cldn18P56857 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cldn18P56857 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cldn18P56857 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cldn18P56857 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cldn18P56857 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms