Protein–RNA interactions for Protein: P56388

Cartpt, Cocaine- and amphetamine-regulated transcript protein, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CartptP56388 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CartptP56388 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CartptP56388 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CartptP56388 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CartptP56388 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CartptP56388 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CartptP56388 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CartptP56388 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CartptP56388 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CartptP56388 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CartptP56388 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CartptP56388 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CartptP56388 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CartptP56388 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CartptP56388 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CartptP56388 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CartptP56388 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CartptP56388 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CartptP56388 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CartptP56388 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CartptP56388 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CartptP56388 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CartptP56388 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CartptP56388 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CartptP56388 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CartptP56388 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CartptP56388 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CartptP56388 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CartptP56388 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CartptP56388 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CartptP56388 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CartptP56388 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CartptP56388 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CartptP56388 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CartptP56388 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CartptP56388 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CartptP56388 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CartptP56388 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CartptP56388 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CartptP56388 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CartptP56388 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CartptP56388 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CartptP56388 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CartptP56388 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CartptP56388 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CartptP56388 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CartptP56388 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CartptP56388 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CartptP56388 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CartptP56388 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CartptP56388 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CartptP56388 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CartptP56388 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CartptP56388 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CartptP56388 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CartptP56388 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CartptP56388 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CartptP56388 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CartptP56388 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CartptP56388 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CartptP56388 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CartptP56388 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CartptP56388 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CartptP56388 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CartptP56388 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CartptP56388 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CartptP56388 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CartptP56388 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CartptP56388 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CartptP56388 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CartptP56388 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CartptP56388 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CartptP56388 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CartptP56388 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CartptP56388 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CartptP56388 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CartptP56388 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CartptP56388 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CartptP56388 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CartptP56388 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CartptP56388 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CartptP56388 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CartptP56388 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CartptP56388 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CartptP56388 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CartptP56388 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CartptP56388 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CartptP56388 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CartptP56388 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CartptP56388 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CartptP56388 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CartptP56388 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CartptP56388 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CartptP56388 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CartptP56388 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CartptP56388 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CartptP56388 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CartptP56388 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CartptP56388 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CartptP56388 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.3 ms