Protein–RNA interactions for Protein: P54846

Nrl, Neural retina-specific leucine zipper protein, mousemouse

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Length 237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrlP54846 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NrlP54846 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NrlP54846 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NrlP54846 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
NrlP54846 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NrlP54846 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NrlP54846 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NrlP54846 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NrlP54846 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NrlP54846 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NrlP54846 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
NrlP54846 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
NrlP54846 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
NrlP54846 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NrlP54846 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NrlP54846 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
NrlP54846 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
NrlP54846 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NrlP54846 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NrlP54846 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NrlP54846 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NrlP54846 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
NrlP54846 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NrlP54846 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NrlP54846 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NrlP54846 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NrlP54846 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NrlP54846 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NrlP54846 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NrlP54846 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NrlP54846 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NrlP54846 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NrlP54846 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NrlP54846 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NrlP54846 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
NrlP54846 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NrlP54846 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NrlP54846 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NrlP54846 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NrlP54846 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NrlP54846 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NrlP54846 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
NrlP54846 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NrlP54846 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NrlP54846 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NrlP54846 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NrlP54846 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
NrlP54846 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
NrlP54846 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NrlP54846 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NrlP54846 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NrlP54846 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
NrlP54846 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
NrlP54846 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
NrlP54846 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NrlP54846 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
NrlP54846 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
NrlP54846 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NrlP54846 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NrlP54846 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
NrlP54846 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NrlP54846 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NrlP54846 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NrlP54846 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NrlP54846 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NrlP54846 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NrlP54846 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NrlP54846 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NrlP54846 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NrlP54846 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NrlP54846 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NrlP54846 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NrlP54846 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NrlP54846 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NrlP54846 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NrlP54846 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NrlP54846 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NrlP54846 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NrlP54846 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NrlP54846 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NrlP54846 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NrlP54846 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NrlP54846 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NrlP54846 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NrlP54846 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NrlP54846 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NrlP54846 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NrlP54846 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NrlP54846 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
NrlP54846 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
NrlP54846 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NrlP54846 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
NrlP54846 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NrlP54846 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NrlP54846 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NrlP54846 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
NrlP54846 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NrlP54846 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NrlP54846 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NrlP54846 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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