Protein–RNA interactions for Protein: P52734

Fgd1, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgd1P52734 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fgd1P52734 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fgd1P52734 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fgd1P52734 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fgd1P52734 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fgd1P52734 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fgd1P52734 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fgd1P52734 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fgd1P52734 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fgd1P52734 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fgd1P52734 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fgd1P52734 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fgd1P52734 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fgd1P52734 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fgd1P52734 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fgd1P52734 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Fgd1P52734 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fgd1P52734 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fgd1P52734 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fgd1P52734 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fgd1P52734 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fgd1P52734 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fgd1P52734 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fgd1P52734 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Fgd1P52734 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Fgd1P52734 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fgd1P52734 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Fgd1P52734 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fgd1P52734 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Fgd1P52734 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fgd1P52734 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fgd1P52734 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fgd1P52734 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fgd1P52734 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fgd1P52734 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Fgd1P52734 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fgd1P52734 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fgd1P52734 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fgd1P52734 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Fgd1P52734 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fgd1P52734 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fgd1P52734 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fgd1P52734 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fgd1P52734 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fgd1P52734 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fgd1P52734 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fgd1P52734 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fgd1P52734 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fgd1P52734 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fgd1P52734 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fgd1P52734 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fgd1P52734 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fgd1P52734 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fgd1P52734 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fgd1P52734 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fgd1P52734 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fgd1P52734 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fgd1P52734 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fgd1P52734 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Fgd1P52734 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fgd1P52734 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fgd1P52734 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fgd1P52734 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Fgd1P52734 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fgd1P52734 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fgd1P52734 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fgd1P52734 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fgd1P52734 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fgd1P52734 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Fgd1P52734 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Fgd1P52734 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fgd1P52734 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fgd1P52734 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fgd1P52734 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fgd1P52734 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fgd1P52734 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Fgd1P52734 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Fgd1P52734 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Fgd1P52734 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Fgd1P52734 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Fgd1P52734 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Fgd1P52734 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Fgd1P52734 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Fgd1P52734 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fgd1P52734 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fgd1P52734 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fgd1P52734 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fgd1P52734 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fgd1P52734 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fgd1P52734 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fgd1P52734 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fgd1P52734 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Fgd1P52734 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fgd1P52734 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fgd1P52734 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fgd1P52734 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fgd1P52734 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fgd1P52734 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fgd1P52734 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Fgd1P52734 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms