Protein–RNA interactions for Protein: P48410

Abcd1, ATP-binding cassette sub-family D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcd1P48410 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Abcd1P48410 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Abcd1P48410 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Abcd1P48410 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Abcd1P48410 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Abcd1P48410 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Abcd1P48410 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Abcd1P48410 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Abcd1P48410 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Abcd1P48410 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Abcd1P48410 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Abcd1P48410 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Abcd1P48410 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Abcd1P48410 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Abcd1P48410 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Abcd1P48410 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Abcd1P48410 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Abcd1P48410 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Abcd1P48410 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Abcd1P48410 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Abcd1P48410 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Abcd1P48410 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Abcd1P48410 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Abcd1P48410 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Abcd1P48410 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Abcd1P48410 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Abcd1P48410 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Abcd1P48410 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Abcd1P48410 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Abcd1P48410 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Abcd1P48410 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Abcd1P48410 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Abcd1P48410 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Abcd1P48410 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Abcd1P48410 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Abcd1P48410 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Abcd1P48410 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Abcd1P48410 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Abcd1P48410 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Abcd1P48410 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Abcd1P48410 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Abcd1P48410 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Abcd1P48410 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Abcd1P48410 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Abcd1P48410 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Abcd1P48410 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Abcd1P48410 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Abcd1P48410 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Abcd1P48410 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Abcd1P48410 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Abcd1P48410 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Abcd1P48410 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Abcd1P48410 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Abcd1P48410 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Abcd1P48410 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Abcd1P48410 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Abcd1P48410 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Abcd1P48410 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Abcd1P48410 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Abcd1P48410 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Abcd1P48410 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Abcd1P48410 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Abcd1P48410 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Abcd1P48410 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Abcd1P48410 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Abcd1P48410 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Abcd1P48410 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Abcd1P48410 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Abcd1P48410 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Abcd1P48410 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Abcd1P48410 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Abcd1P48410 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Abcd1P48410 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Abcd1P48410 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Abcd1P48410 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Abcd1P48410 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Abcd1P48410 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Abcd1P48410 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Abcd1P48410 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Abcd1P48410 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Abcd1P48410 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Abcd1P48410 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Abcd1P48410 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Abcd1P48410 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Abcd1P48410 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Abcd1P48410 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Abcd1P48410 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Abcd1P48410 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Abcd1P48410 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Abcd1P48410 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Abcd1P48410 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Abcd1P48410 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Abcd1P48410 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Abcd1P48410 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Abcd1P48410 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Abcd1P48410 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Abcd1P48410 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Abcd1P48410 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Abcd1P48410 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Abcd1P48410 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms