Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
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