Protein–RNA interactions for Protein: P33215

Nedd1, Protein NEDD1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1P33215 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Nedd1P33215 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Nedd1P33215 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Nedd1P33215 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Nedd1P33215 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Nedd1P33215 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nedd1P33215 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nedd1P33215 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nedd1P33215 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nedd1P33215 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nedd1P33215 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nedd1P33215 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nedd1P33215 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nedd1P33215 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nedd1P33215 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nedd1P33215 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nedd1P33215 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nedd1P33215 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nedd1P33215 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nedd1P33215 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Nedd1P33215 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nedd1P33215 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nedd1P33215 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nedd1P33215 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nedd1P33215 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nedd1P33215 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nedd1P33215 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nedd1P33215 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nedd1P33215 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nedd1P33215 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nedd1P33215 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nedd1P33215 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nedd1P33215 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nedd1P33215 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nedd1P33215 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nedd1P33215 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nedd1P33215 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nedd1P33215 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Nedd1P33215 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nedd1P33215 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nedd1P33215 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nedd1P33215 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nedd1P33215 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nedd1P33215 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Nedd1P33215 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nedd1P33215 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nedd1P33215 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nedd1P33215 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nedd1P33215 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nedd1P33215 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Nedd1P33215 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nedd1P33215 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Nedd1P33215 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nedd1P33215 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nedd1P33215 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nedd1P33215 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nedd1P33215 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nedd1P33215 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nedd1P33215 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nedd1P33215 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nedd1P33215 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nedd1P33215 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nedd1P33215 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Nedd1P33215 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Nedd1P33215 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nedd1P33215 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nedd1P33215 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nedd1P33215 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nedd1P33215 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nedd1P33215 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Nedd1P33215 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nedd1P33215 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nedd1P33215 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nedd1P33215 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nedd1P33215 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nedd1P33215 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nedd1P33215 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nedd1P33215 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nedd1P33215 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nedd1P33215 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nedd1P33215 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nedd1P33215 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nedd1P33215 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nedd1P33215 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nedd1P33215 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nedd1P33215 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nedd1P33215 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nedd1P33215 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nedd1P33215 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nedd1P33215 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nedd1P33215 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nedd1P33215 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nedd1P33215 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nedd1P33215 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nedd1P33215 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nedd1P33215 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nedd1P33215 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nedd1P33215 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nedd1P33215 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nedd1P33215 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms