Protein–RNA interactions for Protein: P28867

Prkcd, Protein kinase C delta type, mousemouse

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Length 674 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcdP28867 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
PrkcdP28867 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
PrkcdP28867 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PrkcdP28867 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PrkcdP28867 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PrkcdP28867 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PrkcdP28867 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PrkcdP28867 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PrkcdP28867 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PrkcdP28867 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PrkcdP28867 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PrkcdP28867 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PrkcdP28867 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PrkcdP28867 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PrkcdP28867 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PrkcdP28867 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PrkcdP28867 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PrkcdP28867 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PrkcdP28867 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PrkcdP28867 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PrkcdP28867 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PrkcdP28867 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PrkcdP28867 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PrkcdP28867 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PrkcdP28867 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PrkcdP28867 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PrkcdP28867 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
PrkcdP28867 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PrkcdP28867 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PrkcdP28867 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PrkcdP28867 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PrkcdP28867 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PrkcdP28867 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
PrkcdP28867 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PrkcdP28867 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PrkcdP28867 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PrkcdP28867 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PrkcdP28867 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PrkcdP28867 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PrkcdP28867 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PrkcdP28867 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PrkcdP28867 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PrkcdP28867 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PrkcdP28867 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PrkcdP28867 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PrkcdP28867 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PrkcdP28867 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
PrkcdP28867 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PrkcdP28867 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PrkcdP28867 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PrkcdP28867 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PrkcdP28867 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PrkcdP28867 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PrkcdP28867 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PrkcdP28867 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PrkcdP28867 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
PrkcdP28867 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PrkcdP28867 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PrkcdP28867 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PrkcdP28867 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PrkcdP28867 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PrkcdP28867 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PrkcdP28867 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PrkcdP28867 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PrkcdP28867 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PrkcdP28867 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PrkcdP28867 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PrkcdP28867 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PrkcdP28867 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PrkcdP28867 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PrkcdP28867 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PrkcdP28867 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PrkcdP28867 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PrkcdP28867 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PrkcdP28867 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PrkcdP28867 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PrkcdP28867 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PrkcdP28867 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PrkcdP28867 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PrkcdP28867 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
PrkcdP28867 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PrkcdP28867 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PrkcdP28867 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PrkcdP28867 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PrkcdP28867 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PrkcdP28867 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PrkcdP28867 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PrkcdP28867 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PrkcdP28867 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PrkcdP28867 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PrkcdP28867 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PrkcdP28867 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PrkcdP28867 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PrkcdP28867 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PrkcdP28867 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PrkcdP28867 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
PrkcdP28867 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
PrkcdP28867 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
PrkcdP28867 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PrkcdP28867 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
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