Protein–RNA interactions for Protein: P28481

Col2a1, Collagen alpha-1(II) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col2a1P28481 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col2a1P28481 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col2a1P28481 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col2a1P28481 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col2a1P28481 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col2a1P28481 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col2a1P28481 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col2a1P28481 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col2a1P28481 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col2a1P28481 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col2a1P28481 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col2a1P28481 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Col2a1P28481 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Col2a1P28481 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col2a1P28481 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col2a1P28481 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col2a1P28481 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col2a1P28481 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Col2a1P28481 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col2a1P28481 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Col2a1P28481 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Col2a1P28481 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Col2a1P28481 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col2a1P28481 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col2a1P28481 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col2a1P28481 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col2a1P28481 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col2a1P28481 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col2a1P28481 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col2a1P28481 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Col2a1P28481 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col2a1P28481 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col2a1P28481 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col2a1P28481 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col2a1P28481 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col2a1P28481 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col2a1P28481 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col2a1P28481 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Col2a1P28481 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col2a1P28481 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Col2a1P28481 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Col2a1P28481 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Col2a1P28481 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Col2a1P28481 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col2a1P28481 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col2a1P28481 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col2a1P28481 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col2a1P28481 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col2a1P28481 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col2a1P28481 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col2a1P28481 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col2a1P28481 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col2a1P28481 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col2a1P28481 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col2a1P28481 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col2a1P28481 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col2a1P28481 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col2a1P28481 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col2a1P28481 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col2a1P28481 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col2a1P28481 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col2a1P28481 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col2a1P28481 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col2a1P28481 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col2a1P28481 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col2a1P28481 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Col2a1P28481 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col2a1P28481 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Col2a1P28481 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col2a1P28481 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col2a1P28481 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col2a1P28481 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col2a1P28481 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col2a1P28481 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col2a1P28481 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Col2a1P28481 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col2a1P28481 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col2a1P28481 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col2a1P28481 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col2a1P28481 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col2a1P28481 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Col2a1P28481 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col2a1P28481 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col2a1P28481 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col2a1P28481 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col2a1P28481 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col2a1P28481 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col2a1P28481 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col2a1P28481 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col2a1P28481 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col2a1P28481 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col2a1P28481 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Col2a1P28481 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col2a1P28481 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col2a1P28481 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Col2a1P28481 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Col2a1P28481 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col2a1P28481 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col2a1P28481 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col2a1P28481 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms