Protein–RNA interactions for Protein: P27659

Rpl3, 60S ribosomal protein L3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 403 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl3P27659 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rpl3P27659 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rpl3P27659 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rpl3P27659 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rpl3P27659 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rpl3P27659 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rpl3P27659 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rpl3P27659 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rpl3P27659 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rpl3P27659 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rpl3P27659 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rpl3P27659 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rpl3P27659 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Rpl3P27659 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rpl3P27659 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rpl3P27659 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rpl3P27659 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpl3P27659 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpl3P27659 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpl3P27659 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpl3P27659 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpl3P27659 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpl3P27659 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpl3P27659 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpl3P27659 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpl3P27659 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpl3P27659 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpl3P27659 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpl3P27659 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpl3P27659 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpl3P27659 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpl3P27659 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpl3P27659 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpl3P27659 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpl3P27659 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpl3P27659 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpl3P27659 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpl3P27659 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpl3P27659 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpl3P27659 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpl3P27659 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpl3P27659 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpl3P27659 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpl3P27659 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpl3P27659 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpl3P27659 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpl3P27659 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpl3P27659 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpl3P27659 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpl3P27659 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpl3P27659 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpl3P27659 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpl3P27659 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpl3P27659 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpl3P27659 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpl3P27659 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpl3P27659 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpl3P27659 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpl3P27659 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpl3P27659 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpl3P27659 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpl3P27659 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpl3P27659 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpl3P27659 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpl3P27659 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpl3P27659 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpl3P27659 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpl3P27659 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpl3P27659 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpl3P27659 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpl3P27659 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpl3P27659 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpl3P27659 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpl3P27659 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpl3P27659 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpl3P27659 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpl3P27659 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpl3P27659 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpl3P27659 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpl3P27659 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpl3P27659 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpl3P27659 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpl3P27659 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpl3P27659 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpl3P27659 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpl3P27659 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpl3P27659 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpl3P27659 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpl3P27659 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpl3P27659 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpl3P27659 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpl3P27659 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpl3P27659 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpl3P27659 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpl3P27659 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpl3P27659 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpl3P27659 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpl3P27659 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpl3P27659 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpl3P27659 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms