Protein–RNA interactions for Protein: P24399

Znf239, Zinc finger protein 239, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf239P24399 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Znf239P24399 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Znf239P24399 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Znf239P24399 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Znf239P24399 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Znf239P24399 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Znf239P24399 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Znf239P24399 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Znf239P24399 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Znf239P24399 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Znf239P24399 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Znf239P24399 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Znf239P24399 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Znf239P24399 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Znf239P24399 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Znf239P24399 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Znf239P24399 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Znf239P24399 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Znf239P24399 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Znf239P24399 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Znf239P24399 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Znf239P24399 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Znf239P24399 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Znf239P24399 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Znf239P24399 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Znf239P24399 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Znf239P24399 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Znf239P24399 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Znf239P24399 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Znf239P24399 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Znf239P24399 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Znf239P24399 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Znf239P24399 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Znf239P24399 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Znf239P24399 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Znf239P24399 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Znf239P24399 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Znf239P24399 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Znf239P24399 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Znf239P24399 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Znf239P24399 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Znf239P24399 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Znf239P24399 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Znf239P24399 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Znf239P24399 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Znf239P24399 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Znf239P24399 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Znf239P24399 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Znf239P24399 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Znf239P24399 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Znf239P24399 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Znf239P24399 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Znf239P24399 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Znf239P24399 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Znf239P24399 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Znf239P24399 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Znf239P24399 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Znf239P24399 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Znf239P24399 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Znf239P24399 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Znf239P24399 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Znf239P24399 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Znf239P24399 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Znf239P24399 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Znf239P24399 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Znf239P24399 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
Znf239P24399 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Znf239P24399 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Znf239P24399 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Znf239P24399 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Znf239P24399 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Znf239P24399 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Znf239P24399 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Znf239P24399 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Znf239P24399 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Znf239P24399 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Znf239P24399 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Znf239P24399 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Znf239P24399 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Znf239P24399 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Znf239P24399 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Znf239P24399 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Znf239P24399 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Znf239P24399 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Znf239P24399 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Znf239P24399 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Znf239P24399 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Znf239P24399 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Znf239P24399 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Znf239P24399 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Znf239P24399 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Znf239P24399 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Znf239P24399 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Znf239P24399 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Znf239P24399 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Znf239P24399 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Znf239P24399 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Znf239P24399 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Znf239P24399 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Znf239P24399 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms