Protein–RNA interactions for Protein: P20263

Pou5f1, POU domain, class 5, transcription factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou5f1P20263 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pou5f1P20263 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pou5f1P20263 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pou5f1P20263 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pou5f1P20263 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Pou5f1P20263 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pou5f1P20263 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pou5f1P20263 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pou5f1P20263 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pou5f1P20263 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pou5f1P20263 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pou5f1P20263 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pou5f1P20263 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pou5f1P20263 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pou5f1P20263 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pou5f1P20263 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pou5f1P20263 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pou5f1P20263 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pou5f1P20263 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Pou5f1P20263 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pou5f1P20263 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pou5f1P20263 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pou5f1P20263 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pou5f1P20263 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pou5f1P20263 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pou5f1P20263 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pou5f1P20263 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pou5f1P20263 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pou5f1P20263 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pou5f1P20263 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pou5f1P20263 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pou5f1P20263 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pou5f1P20263 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pou5f1P20263 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pou5f1P20263 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pou5f1P20263 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Pou5f1P20263 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Pou5f1P20263 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pou5f1P20263 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pou5f1P20263 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pou5f1P20263 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pou5f1P20263 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pou5f1P20263 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pou5f1P20263 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pou5f1P20263 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pou5f1P20263 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pou5f1P20263 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pou5f1P20263 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pou5f1P20263 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pou5f1P20263 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pou5f1P20263 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pou5f1P20263 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Pou5f1P20263 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pou5f1P20263 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pou5f1P20263 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pou5f1P20263 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pou5f1P20263 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pou5f1P20263 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pou5f1P20263 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pou5f1P20263 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Pou5f1P20263 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pou5f1P20263 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pou5f1P20263 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pou5f1P20263 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pou5f1P20263 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pou5f1P20263 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pou5f1P20263 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pou5f1P20263 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pou5f1P20263 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pou5f1P20263 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pou5f1P20263 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pou5f1P20263 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pou5f1P20263 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pou5f1P20263 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pou5f1P20263 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pou5f1P20263 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pou5f1P20263 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pou5f1P20263 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pou5f1P20263 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pou5f1P20263 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pou5f1P20263 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pou5f1P20263 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Pou5f1P20263 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Pou5f1P20263 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Pou5f1P20263 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Pou5f1P20263 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pou5f1P20263 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pou5f1P20263 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pou5f1P20263 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pou5f1P20263 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pou5f1P20263 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pou5f1P20263 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pou5f1P20263 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pou5f1P20263 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pou5f1P20263 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pou5f1P20263 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pou5f1P20263 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pou5f1P20263 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pou5f1P20263 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pou5f1P20263 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.9 ms