Protein–RNA interactions for Protein: P15533

Trim30a, Tripartite motif-containing protein 30A, mousemouse

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim30aP15533 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Trim30aP15533 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim30aP15533 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim30aP15533 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim30aP15533 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim30aP15533 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim30aP15533 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim30aP15533 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim30aP15533 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim30aP15533 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim30aP15533 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim30aP15533 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Trim30aP15533 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim30aP15533 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim30aP15533 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Trim30aP15533 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim30aP15533 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim30aP15533 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Trim30aP15533 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Trim30aP15533 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Trim30aP15533 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Trim30aP15533 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim30aP15533 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim30aP15533 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Trim30aP15533 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim30aP15533 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim30aP15533 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trim30aP15533 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Trim30aP15533 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Trim30aP15533 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trim30aP15533 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trim30aP15533 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Trim30aP15533 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trim30aP15533 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Trim30aP15533 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Trim30aP15533 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Trim30aP15533 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Trim30aP15533 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trim30aP15533 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Trim30aP15533 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trim30aP15533 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trim30aP15533 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trim30aP15533 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Trim30aP15533 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trim30aP15533 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trim30aP15533 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trim30aP15533 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trim30aP15533 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Trim30aP15533 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Trim30aP15533 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trim30aP15533 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trim30aP15533 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Trim30aP15533 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trim30aP15533 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trim30aP15533 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trim30aP15533 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trim30aP15533 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trim30aP15533 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trim30aP15533 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trim30aP15533 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Trim30aP15533 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trim30aP15533 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trim30aP15533 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trim30aP15533 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trim30aP15533 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trim30aP15533 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trim30aP15533 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trim30aP15533 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trim30aP15533 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trim30aP15533 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trim30aP15533 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trim30aP15533 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trim30aP15533 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trim30aP15533 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trim30aP15533 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trim30aP15533 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Trim30aP15533 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Trim30aP15533 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trim30aP15533 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trim30aP15533 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Trim30aP15533 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Trim30aP15533 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Trim30aP15533 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trim30aP15533 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Trim30aP15533 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trim30aP15533 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trim30aP15533 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trim30aP15533 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trim30aP15533 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trim30aP15533 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trim30aP15533 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trim30aP15533 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trim30aP15533 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Trim30aP15533 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trim30aP15533 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Trim30aP15533 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trim30aP15533 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trim30aP15533 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Trim30aP15533 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Trim30aP15533 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.2 ms