Protein–RNA interactions for Protein: P11416

Rara, Retinoic acid receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RaraP11416 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RaraP11416 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RaraP11416 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RaraP11416 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
RaraP11416 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RaraP11416 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RaraP11416 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RaraP11416 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
RaraP11416 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
RaraP11416 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RaraP11416 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RaraP11416 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
RaraP11416 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RaraP11416 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RaraP11416 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RaraP11416 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RaraP11416 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RaraP11416 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RaraP11416 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RaraP11416 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RaraP11416 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RaraP11416 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RaraP11416 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RaraP11416 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RaraP11416 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RaraP11416 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RaraP11416 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RaraP11416 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RaraP11416 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RaraP11416 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RaraP11416 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RaraP11416 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RaraP11416 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RaraP11416 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RaraP11416 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RaraP11416 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RaraP11416 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
RaraP11416 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
RaraP11416 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RaraP11416 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RaraP11416 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RaraP11416 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RaraP11416 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RaraP11416 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RaraP11416 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RaraP11416 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RaraP11416 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RaraP11416 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RaraP11416 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RaraP11416 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RaraP11416 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RaraP11416 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RaraP11416 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RaraP11416 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RaraP11416 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RaraP11416 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RaraP11416 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RaraP11416 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RaraP11416 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RaraP11416 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RaraP11416 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RaraP11416 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RaraP11416 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RaraP11416 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RaraP11416 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RaraP11416 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RaraP11416 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RaraP11416 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RaraP11416 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RaraP11416 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RaraP11416 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RaraP11416 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RaraP11416 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
RaraP11416 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RaraP11416 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RaraP11416 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
RaraP11416 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
RaraP11416 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RaraP11416 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RaraP11416 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RaraP11416 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RaraP11416 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RaraP11416 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RaraP11416 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RaraP11416 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RaraP11416 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RaraP11416 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RaraP11416 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RaraP11416 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RaraP11416 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RaraP11416 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RaraP11416 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RaraP11416 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RaraP11416 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RaraP11416 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RaraP11416 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RaraP11416 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RaraP11416 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RaraP11416 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RaraP11416 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms