Protein–RNA interactions for Protein: P01665

Ig kappa chain V-III region PC 7043, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01665 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
P01665 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
P01665 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
P01665 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
P01665 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
P01665 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
P01665 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
P01665 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
P01665 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
P01665 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
P01665 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
P01665 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
P01665 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
P01665 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
P01665 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
P01665 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
P01665 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
P01665 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P01665 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
P01665 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P01665 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
P01665 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
P01665 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
P01665 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
P01665 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
P01665 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
P01665 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P01665 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P01665 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P01665 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P01665 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P01665 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
P01665 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
P01665 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
P01665 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
P01665 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
P01665 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
P01665 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P01665 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P01665 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P01665 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P01665 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P01665 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
P01665 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
P01665 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P01665 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P01665 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P01665 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P01665 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P01665 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
P01665 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P01665 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P01665 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P01665 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
P01665 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P01665 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P01665 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P01665 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01665 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01665 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01665 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01665 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01665 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01665 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01665 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01665 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01665 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01665 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01665 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01665 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
P01665 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01665 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01665 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01665 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01665 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01665 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01665 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01665 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01665 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01665 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01665 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01665 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01665 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
P01665 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01665 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01665 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01665 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01665 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01665 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01665 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01665 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
P01665 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
P01665 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01665 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01665 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01665 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01665 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01665 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01665 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01665 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.4 ms