Protein–RNA interactions for Protein: O54917

E2f6, Transcription factor E2F6, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2f6O54917 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
E2f6O54917 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
E2f6O54917 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
E2f6O54917 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
E2f6O54917 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
E2f6O54917 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
E2f6O54917 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
E2f6O54917 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
E2f6O54917 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
E2f6O54917 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
E2f6O54917 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
E2f6O54917 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
E2f6O54917 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
E2f6O54917 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
E2f6O54917 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
E2f6O54917 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
E2f6O54917 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
E2f6O54917 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
E2f6O54917 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
E2f6O54917 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
E2f6O54917 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
E2f6O54917 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
E2f6O54917 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
E2f6O54917 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
E2f6O54917 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
E2f6O54917 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
E2f6O54917 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
E2f6O54917 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
E2f6O54917 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
E2f6O54917 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
E2f6O54917 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
E2f6O54917 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
E2f6O54917 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
E2f6O54917 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
E2f6O54917 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
E2f6O54917 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
E2f6O54917 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
E2f6O54917 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
E2f6O54917 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
E2f6O54917 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
E2f6O54917 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
E2f6O54917 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
E2f6O54917 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
E2f6O54917 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
E2f6O54917 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
E2f6O54917 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
E2f6O54917 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
E2f6O54917 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
E2f6O54917 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
E2f6O54917 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
E2f6O54917 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
E2f6O54917 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
E2f6O54917 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
E2f6O54917 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
E2f6O54917 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
E2f6O54917 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
E2f6O54917 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
E2f6O54917 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
E2f6O54917 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
E2f6O54917 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
E2f6O54917 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
E2f6O54917 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
E2f6O54917 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
E2f6O54917 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
E2f6O54917 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
E2f6O54917 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
E2f6O54917 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
E2f6O54917 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
E2f6O54917 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
E2f6O54917 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
E2f6O54917 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
E2f6O54917 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
E2f6O54917 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
E2f6O54917 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
E2f6O54917 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
E2f6O54917 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
E2f6O54917 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
E2f6O54917 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
E2f6O54917 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
E2f6O54917 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
E2f6O54917 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
E2f6O54917 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
E2f6O54917 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
E2f6O54917 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
E2f6O54917 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
E2f6O54917 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
E2f6O54917 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
E2f6O54917 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
E2f6O54917 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
E2f6O54917 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
E2f6O54917 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
E2f6O54917 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
E2f6O54917 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
E2f6O54917 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
E2f6O54917 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
E2f6O54917 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
E2f6O54917 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
E2f6O54917 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
E2f6O54917 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
E2f6O54917 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms