Protein–RNA interactions for Protein: O35903

Ccl25, C-C motif chemokine 25, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl25O35903 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ccl25O35903 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Ccl25O35903 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ccl25O35903 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ccl25O35903 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ccl25O35903 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ccl25O35903 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ccl25O35903 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ccl25O35903 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ccl25O35903 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ccl25O35903 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ccl25O35903 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ccl25O35903 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ccl25O35903 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ccl25O35903 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ccl25O35903 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ccl25O35903 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ccl25O35903 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ccl25O35903 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ccl25O35903 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Ccl25O35903 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ccl25O35903 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ccl25O35903 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ccl25O35903 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ccl25O35903 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ccl25O35903 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ccl25O35903 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ccl25O35903 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ccl25O35903 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ccl25O35903 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ccl25O35903 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ccl25O35903 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Ccl25O35903 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ccl25O35903 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ccl25O35903 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ccl25O35903 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ccl25O35903 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ccl25O35903 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ccl25O35903 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ccl25O35903 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ccl25O35903 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ccl25O35903 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ccl25O35903 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ccl25O35903 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Ccl25O35903 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ccl25O35903 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ccl25O35903 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ccl25O35903 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ccl25O35903 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ccl25O35903 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ccl25O35903 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ccl25O35903 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ccl25O35903 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ccl25O35903 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ccl25O35903 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ccl25O35903 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ccl25O35903 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ccl25O35903 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Ccl25O35903 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ccl25O35903 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ccl25O35903 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ccl25O35903 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ccl25O35903 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ccl25O35903 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Ccl25O35903 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ccl25O35903 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ccl25O35903 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ccl25O35903 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Ccl25O35903 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ccl25O35903 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ccl25O35903 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ccl25O35903 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ccl25O35903 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ccl25O35903 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ccl25O35903 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ccl25O35903 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ccl25O35903 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ccl25O35903 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ccl25O35903 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Ccl25O35903 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ccl25O35903 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ccl25O35903 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ccl25O35903 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ccl25O35903 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ccl25O35903 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ccl25O35903 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ccl25O35903 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ccl25O35903 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ccl25O35903 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ccl25O35903 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ccl25O35903 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ccl25O35903 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ccl25O35903 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ccl25O35903 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ccl25O35903 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ccl25O35903 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ccl25O35903 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ccl25O35903 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ccl25O35903 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ccl25O35903 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 125.5 ms