Protein–RNA interactions for Protein: O09005

Degs1, Sphingolipid delta(4)-desaturase DES1, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Degs1O09005 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Degs1O09005 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Degs1O09005 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Degs1O09005 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Degs1O09005 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Degs1O09005 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Degs1O09005 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Degs1O09005 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Degs1O09005 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Degs1O09005 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Degs1O09005 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Degs1O09005 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Degs1O09005 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Degs1O09005 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Degs1O09005 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Degs1O09005 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Degs1O09005 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Degs1O09005 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Degs1O09005 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Degs1O09005 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Degs1O09005 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Degs1O09005 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Degs1O09005 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Degs1O09005 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Degs1O09005 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Degs1O09005 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Degs1O09005 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Degs1O09005 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Degs1O09005 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Degs1O09005 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Degs1O09005 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Degs1O09005 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Degs1O09005 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Degs1O09005 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Degs1O09005 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Degs1O09005 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Degs1O09005 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Degs1O09005 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Degs1O09005 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Degs1O09005 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Degs1O09005 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Degs1O09005 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Degs1O09005 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Degs1O09005 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Degs1O09005 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Degs1O09005 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Degs1O09005 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Degs1O09005 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Degs1O09005 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Degs1O09005 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Degs1O09005 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Degs1O09005 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Degs1O09005 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Degs1O09005 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Degs1O09005 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Degs1O09005 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Degs1O09005 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Degs1O09005 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Degs1O09005 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Degs1O09005 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Degs1O09005 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Degs1O09005 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Degs1O09005 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Degs1O09005 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Degs1O09005 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Degs1O09005 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Degs1O09005 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Degs1O09005 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Degs1O09005 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Degs1O09005 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Degs1O09005 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Degs1O09005 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Degs1O09005 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Degs1O09005 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Degs1O09005 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Degs1O09005 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Degs1O09005 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Degs1O09005 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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