Protein–RNA interactions for Protein: M0QWN7

Usp35, Ubiquitin-specific peptidase 35, mousemouse

Predictions only

Length 1,009 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp35M0QWN7 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp35M0QWN7 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp35M0QWN7 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp35M0QWN7 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp35M0QWN7 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp35M0QWN7 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp35M0QWN7 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp35M0QWN7 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp35M0QWN7 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp35M0QWN7 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp35M0QWN7 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp35M0QWN7 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp35M0QWN7 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp35M0QWN7 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp35M0QWN7 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp35M0QWN7 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp35M0QWN7 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp35M0QWN7 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp35M0QWN7 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp35M0QWN7 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp35M0QWN7 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp35M0QWN7 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp35M0QWN7 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp35M0QWN7 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp35M0QWN7 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp35M0QWN7 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp35M0QWN7 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp35M0QWN7 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp35M0QWN7 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp35M0QWN7 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp35M0QWN7 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp35M0QWN7 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp35M0QWN7 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp35M0QWN7 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp35M0QWN7 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp35M0QWN7 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp35M0QWN7 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp35M0QWN7 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp35M0QWN7 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp35M0QWN7 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp35M0QWN7 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp35M0QWN7 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp35M0QWN7 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp35M0QWN7 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp35M0QWN7 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp35M0QWN7 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp35M0QWN7 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp35M0QWN7 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp35M0QWN7 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp35M0QWN7 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp35M0QWN7 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp35M0QWN7 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp35M0QWN7 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp35M0QWN7 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp35M0QWN7 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp35M0QWN7 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp35M0QWN7 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp35M0QWN7 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp35M0QWN7 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp35M0QWN7 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp35M0QWN7 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp35M0QWN7 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp35M0QWN7 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp35M0QWN7 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp35M0QWN7 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp35M0QWN7 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp35M0QWN7 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp35M0QWN7 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp35M0QWN7 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp35M0QWN7 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp35M0QWN7 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp35M0QWN7 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp35M0QWN7 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp35M0QWN7 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp35M0QWN7 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp35M0QWN7 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp35M0QWN7 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp35M0QWN7 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp35M0QWN7 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp35M0QWN7 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp35M0QWN7 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp35M0QWN7 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp35M0QWN7 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp35M0QWN7 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp35M0QWN7 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp35M0QWN7 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp35M0QWN7 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp35M0QWN7 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp35M0QWN7 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp35M0QWN7 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp35M0QWN7 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp35M0QWN7 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp35M0QWN7 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp35M0QWN7 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp35M0QWN7 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp35M0QWN7 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp35M0QWN7 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp35M0QWN7 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp35M0QWN7 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp35M0QWN7 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms