Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ54

Gcom1, GRINL1A complex locus, mousemouse

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcom1E9PZ54 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gcom1E9PZ54 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gcom1E9PZ54 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gcom1E9PZ54 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gcom1E9PZ54 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Gcom1E9PZ54 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gcom1E9PZ54 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gcom1E9PZ54 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gcom1E9PZ54 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Gcom1E9PZ54 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gcom1E9PZ54 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gcom1E9PZ54 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gcom1E9PZ54 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gcom1E9PZ54 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gcom1E9PZ54 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gcom1E9PZ54 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gcom1E9PZ54 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gcom1E9PZ54 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gcom1E9PZ54 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gcom1E9PZ54 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gcom1E9PZ54 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gcom1E9PZ54 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gcom1E9PZ54 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gcom1E9PZ54 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gcom1E9PZ54 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gcom1E9PZ54 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gcom1E9PZ54 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gcom1E9PZ54 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gcom1E9PZ54 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gcom1E9PZ54 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gcom1E9PZ54 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gcom1E9PZ54 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gcom1E9PZ54 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gcom1E9PZ54 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gcom1E9PZ54 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gcom1E9PZ54 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gcom1E9PZ54 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gcom1E9PZ54 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gcom1E9PZ54 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Gcom1E9PZ54 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gcom1E9PZ54 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gcom1E9PZ54 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gcom1E9PZ54 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gcom1E9PZ54 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Gcom1E9PZ54 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gcom1E9PZ54 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gcom1E9PZ54 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gcom1E9PZ54 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gcom1E9PZ54 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gcom1E9PZ54 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gcom1E9PZ54 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gcom1E9PZ54 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gcom1E9PZ54 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gcom1E9PZ54 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gcom1E9PZ54 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gcom1E9PZ54 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gcom1E9PZ54 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gcom1E9PZ54 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Gcom1E9PZ54 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gcom1E9PZ54 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gcom1E9PZ54 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gcom1E9PZ54 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Gcom1E9PZ54 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gcom1E9PZ54 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gcom1E9PZ54 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gcom1E9PZ54 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gcom1E9PZ54 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gcom1E9PZ54 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gcom1E9PZ54 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gcom1E9PZ54 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gcom1E9PZ54 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gcom1E9PZ54 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gcom1E9PZ54 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gcom1E9PZ54 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Gcom1E9PZ54 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gcom1E9PZ54 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gcom1E9PZ54 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gcom1E9PZ54 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gcom1E9PZ54 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Gcom1E9PZ54 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Gcom1E9PZ54 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Gcom1E9PZ54 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gcom1E9PZ54 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gcom1E9PZ54 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gcom1E9PZ54 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gcom1E9PZ54 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gcom1E9PZ54 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Gcom1E9PZ54 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gcom1E9PZ54 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gcom1E9PZ54 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gcom1E9PZ54 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Gcom1E9PZ54 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gcom1E9PZ54 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gcom1E9PZ54 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gcom1E9PZ54 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gcom1E9PZ54 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gcom1E9PZ54 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gcom1E9PZ54 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gcom1E9PZ54 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gcom1E9PZ54 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.2 ms