Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6J4

Vpreb3, Pre-B lymphocyte gene 3, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb3D3Z6J4 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Vpreb3D3Z6J4 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Vpreb3D3Z6J4 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Vpreb3D3Z6J4 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Vpreb3D3Z6J4 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
Vpreb3D3Z6J4 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
Vpreb3D3Z6J4 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
Vpreb3D3Z6J4 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
Vpreb3D3Z6J4 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
Vpreb3D3Z6J4 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Vpreb3D3Z6J4 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
Vpreb3D3Z6J4 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Vpreb3D3Z6J4 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Vpreb3D3Z6J4 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Vpreb3D3Z6J4 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Vpreb3D3Z6J4 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Vpreb3D3Z6J4 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Vpreb3D3Z6J4 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Vpreb3D3Z6J4 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Vpreb3D3Z6J4 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Vpreb3D3Z6J4 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Vpreb3D3Z6J4 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
Vpreb3D3Z6J4 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Vpreb3D3Z6J4 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Vpreb3D3Z6J4 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Vpreb3D3Z6J4 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Vpreb3D3Z6J4 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Vpreb3D3Z6J4 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
Vpreb3D3Z6J4 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Vpreb3D3Z6J4 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Vpreb3D3Z6J4 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Vpreb3D3Z6J4 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Vpreb3D3Z6J4 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Vpreb3D3Z6J4 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Vpreb3D3Z6J4 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Vpreb3D3Z6J4 Madd-208ENSMUST00000111370 5879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Vpreb3D3Z6J4 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Vpreb3D3Z6J4 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Vpreb3D3Z6J4 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Vpreb3D3Z6J4 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Vpreb3D3Z6J4 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Vpreb3D3Z6J4 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Vpreb3D3Z6J4 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Vpreb3D3Z6J4 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Vpreb3D3Z6J4 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Vpreb3D3Z6J4 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Vpreb3D3Z6J4 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Vpreb3D3Z6J4 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Vpreb3D3Z6J4 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Vpreb3D3Z6J4 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Vpreb3D3Z6J4 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Vpreb3D3Z6J4 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Vpreb3D3Z6J4 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Vpreb3D3Z6J4 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Vpreb3D3Z6J4 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Vpreb3D3Z6J4 Bach1-201ENSMUST00000026703 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Vpreb3D3Z6J4 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Vpreb3D3Z6J4 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Vpreb3D3Z6J4 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Vpreb3D3Z6J4 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Vpreb3D3Z6J4 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
Vpreb3D3Z6J4 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
Vpreb3D3Z6J4 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Vpreb3D3Z6J4 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Vpreb3D3Z6J4 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Vpreb3D3Z6J4 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
Vpreb3D3Z6J4 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Vpreb3D3Z6J4 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
Vpreb3D3Z6J4 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Vpreb3D3Z6J4 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
Vpreb3D3Z6J4 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Vpreb3D3Z6J4 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Vpreb3D3Z6J4 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
Vpreb3D3Z6J4 Phactr1-213ENSMUST00000148891 5307 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Vpreb3D3Z6J4 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Vpreb3D3Z6J4 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Vpreb3D3Z6J4 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Vpreb3D3Z6J4 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Vpreb3D3Z6J4 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Vpreb3D3Z6J4 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Vpreb3D3Z6J4 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Vpreb3D3Z6J4 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Vpreb3D3Z6J4 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Vpreb3D3Z6J4 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Vpreb3D3Z6J4 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
Vpreb3D3Z6J4 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Vpreb3D3Z6J4 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Vpreb3D3Z6J4 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
Vpreb3D3Z6J4 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Vpreb3D3Z6J4 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Vpreb3D3Z6J4 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Vpreb3D3Z6J4 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Vpreb3D3Z6J4 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Vpreb3D3Z6J4 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Vpreb3D3Z6J4 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Vpreb3D3Z6J4 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Vpreb3D3Z6J4 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Vpreb3D3Z6J4 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Vpreb3D3Z6J4 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Vpreb3D3Z6J4 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms