Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms