Protein–RNA interactions for Protein: B9EHT4

Clip3, CAP-Gly domain-containing linker protein 3, mousemouse

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Length 547 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip3B9EHT4 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Clip3B9EHT4 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Clip3B9EHT4 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Clip3B9EHT4 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Clip3B9EHT4 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Clip3B9EHT4 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Clip3B9EHT4 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Clip3B9EHT4 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Clip3B9EHT4 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Clip3B9EHT4 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Clip3B9EHT4 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Clip3B9EHT4 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Clip3B9EHT4 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Clip3B9EHT4 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Clip3B9EHT4 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Clip3B9EHT4 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Clip3B9EHT4 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Clip3B9EHT4 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Clip3B9EHT4 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Clip3B9EHT4 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Clip3B9EHT4 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Clip3B9EHT4 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Clip3B9EHT4 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Clip3B9EHT4 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Clip3B9EHT4 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Clip3B9EHT4 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Clip3B9EHT4 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Clip3B9EHT4 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Clip3B9EHT4 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Clip3B9EHT4 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Clip3B9EHT4 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Clip3B9EHT4 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Clip3B9EHT4 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Clip3B9EHT4 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Clip3B9EHT4 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Clip3B9EHT4 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Clip3B9EHT4 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Clip3B9EHT4 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Clip3B9EHT4 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Clip3B9EHT4 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Clip3B9EHT4 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Clip3B9EHT4 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Clip3B9EHT4 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Clip3B9EHT4 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Clip3B9EHT4 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Clip3B9EHT4 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Clip3B9EHT4 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Clip3B9EHT4 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Clip3B9EHT4 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Clip3B9EHT4 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Clip3B9EHT4 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Clip3B9EHT4 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Clip3B9EHT4 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Clip3B9EHT4 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Clip3B9EHT4 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Clip3B9EHT4 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Clip3B9EHT4 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Clip3B9EHT4 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Clip3B9EHT4 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Clip3B9EHT4 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Clip3B9EHT4 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Clip3B9EHT4 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Clip3B9EHT4 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Clip3B9EHT4 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Clip3B9EHT4 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Clip3B9EHT4 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Clip3B9EHT4 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Clip3B9EHT4 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Clip3B9EHT4 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Clip3B9EHT4 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Clip3B9EHT4 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Clip3B9EHT4 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Clip3B9EHT4 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Clip3B9EHT4 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Clip3B9EHT4 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Clip3B9EHT4 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Clip3B9EHT4 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Clip3B9EHT4 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Clip3B9EHT4 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Clip3B9EHT4 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Clip3B9EHT4 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Clip3B9EHT4 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Clip3B9EHT4 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Clip3B9EHT4 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Clip3B9EHT4 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Clip3B9EHT4 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Clip3B9EHT4 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Clip3B9EHT4 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Clip3B9EHT4 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Clip3B9EHT4 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Clip3B9EHT4 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Clip3B9EHT4 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Clip3B9EHT4 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Clip3B9EHT4 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Clip3B9EHT4 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Clip3B9EHT4 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Clip3B9EHT4 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Clip3B9EHT4 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Clip3B9EHT4 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Clip3B9EHT4 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
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