Protein–RNA interactions for Protein: B2RRD7

Brpf1, Peregrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf1B2RRD7 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Brpf1B2RRD7 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Brpf1B2RRD7 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Brpf1B2RRD7 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Brpf1B2RRD7 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Brpf1B2RRD7 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Brpf1B2RRD7 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Brpf1B2RRD7 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Brpf1B2RRD7 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Brpf1B2RRD7 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Brpf1B2RRD7 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Brpf1B2RRD7 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Brpf1B2RRD7 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Brpf1B2RRD7 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Brpf1B2RRD7 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Brpf1B2RRD7 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Brpf1B2RRD7 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Brpf1B2RRD7 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Brpf1B2RRD7 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Brpf1B2RRD7 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Brpf1B2RRD7 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Brpf1B2RRD7 Gm20614-201ENSMUST00000177106 632 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Brpf1B2RRD7 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Brpf1B2RRD7 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Brpf1B2RRD7 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Brpf1B2RRD7 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Brpf1B2RRD7 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Brpf1B2RRD7 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Brpf1B2RRD7 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Brpf1B2RRD7 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Brpf1B2RRD7 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Brpf1B2RRD7 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Brpf1B2RRD7 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Brpf1B2RRD7 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Brpf1B2RRD7 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Brpf1B2RRD7 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Brpf1B2RRD7 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Brpf1B2RRD7 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Brpf1B2RRD7 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Brpf1B2RRD7 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Brpf1B2RRD7 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Brpf1B2RRD7 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Brpf1B2RRD7 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Brpf1B2RRD7 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Brpf1B2RRD7 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Brpf1B2RRD7 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Brpf1B2RRD7 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Brpf1B2RRD7 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Brpf1B2RRD7 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Brpf1B2RRD7 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Brpf1B2RRD7 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Brpf1B2RRD7 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Brpf1B2RRD7 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Brpf1B2RRD7 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Brpf1B2RRD7 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Brpf1B2RRD7 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Brpf1B2RRD7 Gm2594-201ENSMUST00000214774 742 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Brpf1B2RRD7 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Brpf1B2RRD7 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Brpf1B2RRD7 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Brpf1B2RRD7 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Brpf1B2RRD7 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Brpf1B2RRD7 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Brpf1B2RRD7 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Brpf1B2RRD7 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Brpf1B2RRD7 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Brpf1B2RRD7 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Brpf1B2RRD7 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Brpf1B2RRD7 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Brpf1B2RRD7 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Brpf1B2RRD7 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Brpf1B2RRD7 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Brpf1B2RRD7 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Brpf1B2RRD7 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Brpf1B2RRD7 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Brpf1B2RRD7 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Brpf1B2RRD7 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Brpf1B2RRD7 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Brpf1B2RRD7 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Brpf1B2RRD7 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Brpf1B2RRD7 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Brpf1B2RRD7 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Brpf1B2RRD7 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Brpf1B2RRD7 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Brpf1B2RRD7 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Brpf1B2RRD7 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Brpf1B2RRD7 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Brpf1B2RRD7 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Brpf1B2RRD7 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Brpf1B2RRD7 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Brpf1B2RRD7 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Brpf1B2RRD7 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Brpf1B2RRD7 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Brpf1B2RRD7 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Brpf1B2RRD7 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Brpf1B2RRD7 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Brpf1B2RRD7 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Brpf1B2RRD7 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Brpf1B2RRD7 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Brpf1B2RRD7 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms