Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Q2

Knop1, Lysine-rich nucleolar protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Knop1Q9Z2Q2 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Knop1Q9Z2Q2 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Knop1Q9Z2Q2 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Knop1Q9Z2Q2 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Knop1Q9Z2Q2 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Knop1Q9Z2Q2 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Knop1Q9Z2Q2 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Knop1Q9Z2Q2 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Knop1Q9Z2Q2 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Knop1Q9Z2Q2 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Knop1Q9Z2Q2 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Knop1Q9Z2Q2 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Knop1Q9Z2Q2 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Knop1Q9Z2Q2 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Knop1Q9Z2Q2 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Knop1Q9Z2Q2 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Knop1Q9Z2Q2 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Knop1Q9Z2Q2 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Knop1Q9Z2Q2 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Knop1Q9Z2Q2 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Knop1Q9Z2Q2 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Knop1Q9Z2Q2 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Knop1Q9Z2Q2 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Knop1Q9Z2Q2 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Knop1Q9Z2Q2 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Knop1Q9Z2Q2 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Knop1Q9Z2Q2 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Knop1Q9Z2Q2 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Knop1Q9Z2Q2 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Knop1Q9Z2Q2 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Knop1Q9Z2Q2 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Knop1Q9Z2Q2 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Knop1Q9Z2Q2 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Knop1Q9Z2Q2 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Knop1Q9Z2Q2 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Knop1Q9Z2Q2 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Knop1Q9Z2Q2 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Knop1Q9Z2Q2 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Knop1Q9Z2Q2 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Knop1Q9Z2Q2 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Knop1Q9Z2Q2 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Knop1Q9Z2Q2 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Knop1Q9Z2Q2 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Knop1Q9Z2Q2 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Knop1Q9Z2Q2 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Knop1Q9Z2Q2 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Knop1Q9Z2Q2 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Knop1Q9Z2Q2 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Knop1Q9Z2Q2 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Knop1Q9Z2Q2 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Knop1Q9Z2Q2 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Knop1Q9Z2Q2 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Knop1Q9Z2Q2 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Knop1Q9Z2Q2 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Knop1Q9Z2Q2 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Knop1Q9Z2Q2 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Knop1Q9Z2Q2 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Knop1Q9Z2Q2 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Knop1Q9Z2Q2 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Knop1Q9Z2Q2 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Knop1Q9Z2Q2 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Knop1Q9Z2Q2 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Knop1Q9Z2Q2 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Knop1Q9Z2Q2 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Knop1Q9Z2Q2 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Knop1Q9Z2Q2 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Knop1Q9Z2Q2 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Knop1Q9Z2Q2 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Knop1Q9Z2Q2 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Knop1Q9Z2Q2 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Knop1Q9Z2Q2 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Knop1Q9Z2Q2 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Knop1Q9Z2Q2 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Knop1Q9Z2Q2 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Knop1Q9Z2Q2 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Knop1Q9Z2Q2 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Knop1Q9Z2Q2 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Knop1Q9Z2Q2 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Knop1Q9Z2Q2 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Knop1Q9Z2Q2 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Knop1Q9Z2Q2 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Knop1Q9Z2Q2 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Knop1Q9Z2Q2 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Knop1Q9Z2Q2 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Knop1Q9Z2Q2 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Knop1Q9Z2Q2 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Knop1Q9Z2Q2 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Knop1Q9Z2Q2 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Knop1Q9Z2Q2 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Knop1Q9Z2Q2 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Knop1Q9Z2Q2 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Knop1Q9Z2Q2 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Knop1Q9Z2Q2 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Knop1Q9Z2Q2 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Knop1Q9Z2Q2 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Knop1Q9Z2Q2 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Knop1Q9Z2Q2 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Knop1Q9Z2Q2 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Knop1Q9Z2Q2 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Knop1Q9Z2Q2 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms