Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZR9

Col4a4, Collagen alpha-4(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a4Q9QZR9 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Col4a4Q9QZR9 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Col4a4Q9QZR9 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Col4a4Q9QZR9 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Col4a4Q9QZR9 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Col4a4Q9QZR9 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Col4a4Q9QZR9 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Col4a4Q9QZR9 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Col4a4Q9QZR9 Rps9-204ENSMUST00000108625 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Col4a4Q9QZR9 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Col4a4Q9QZR9 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Col4a4Q9QZR9 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Col4a4Q9QZR9 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Col4a4Q9QZR9 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Col4a4Q9QZR9 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Col4a4Q9QZR9 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Col4a4Q9QZR9 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Col4a4Q9QZR9 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Col4a4Q9QZR9 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Col4a4Q9QZR9 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Col4a4Q9QZR9 Defb36-201ENSMUST00000058086 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Col4a4Q9QZR9 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Col4a4Q9QZR9 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Col4a4Q9QZR9 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Col4a4Q9QZR9 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Col4a4Q9QZR9 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Col4a4Q9QZR9 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Col4a4Q9QZR9 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Col4a4Q9QZR9 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Col4a4Q9QZR9 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Col4a4Q9QZR9 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Col4a4Q9QZR9 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Col4a4Q9QZR9 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col4a4Q9QZR9 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col4a4Q9QZR9 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col4a4Q9QZR9 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col4a4Q9QZR9 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col4a4Q9QZR9 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Col4a4Q9QZR9 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col4a4Q9QZR9 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col4a4Q9QZR9 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col4a4Q9QZR9 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col4a4Q9QZR9 Ccdc163-204ENSMUST00000106464 1213 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col4a4Q9QZR9 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Col4a4Q9QZR9 Gm14965-201ENSMUST00000124118 565 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col4a4Q9QZR9 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col4a4Q9QZR9 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col4a4Q9QZR9 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col4a4Q9QZR9 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col4a4Q9QZR9 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Col4a4Q9QZR9 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col4a4Q9QZR9 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col4a4Q9QZR9 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col4a4Q9QZR9 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col4a4Q9QZR9 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col4a4Q9QZR9 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col4a4Q9QZR9 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col4a4Q9QZR9 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col4a4Q9QZR9 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col4a4Q9QZR9 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col4a4Q9QZR9 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col4a4Q9QZR9 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col4a4Q9QZR9 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col4a4Q9QZR9 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col4a4Q9QZR9 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col4a4Q9QZR9 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col4a4Q9QZR9 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col4a4Q9QZR9 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col4a4Q9QZR9 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col4a4Q9QZR9 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col4a4Q9QZR9 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col4a4Q9QZR9 Cav2-202ENSMUST00000115459 974 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col4a4Q9QZR9 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Col4a4Q9QZR9 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Col4a4Q9QZR9 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Col4a4Q9QZR9 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col4a4Q9QZR9 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col4a4Q9QZR9 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col4a4Q9QZR9 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col4a4Q9QZR9 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Col4a4Q9QZR9 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col4a4Q9QZR9 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col4a4Q9QZR9 AC132901.1-201ENSMUST00000224345 508 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Col4a4Q9QZR9 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col4a4Q9QZR9 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col4a4Q9QZR9 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col4a4Q9QZR9 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col4a4Q9QZR9 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col4a4Q9QZR9 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col4a4Q9QZR9 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col4a4Q9QZR9 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col4a4Q9QZR9 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col4a4Q9QZR9 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col4a4Q9QZR9 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col4a4Q9QZR9 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Col4a4Q9QZR9 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col4a4Q9QZR9 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col4a4Q9QZR9 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col4a4Q9QZR9 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col4a4Q9QZR9 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms