Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZL6

Usp21, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 21, mousemouse

Predictions only

Length 566 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp21Q9QZL6 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp21Q9QZL6 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp21Q9QZL6 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp21Q9QZL6 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp21Q9QZL6 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp21Q9QZL6 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp21Q9QZL6 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp21Q9QZL6 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp21Q9QZL6 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp21Q9QZL6 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp21Q9QZL6 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp21Q9QZL6 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp21Q9QZL6 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp21Q9QZL6 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp21Q9QZL6 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp21Q9QZL6 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp21Q9QZL6 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp21Q9QZL6 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp21Q9QZL6 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp21Q9QZL6 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp21Q9QZL6 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp21Q9QZL6 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp21Q9QZL6 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp21Q9QZL6 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp21Q9QZL6 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp21Q9QZL6 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp21Q9QZL6 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp21Q9QZL6 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp21Q9QZL6 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp21Q9QZL6 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp21Q9QZL6 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp21Q9QZL6 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp21Q9QZL6 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp21Q9QZL6 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp21Q9QZL6 Higd1c-201ENSMUST00000175683 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp21Q9QZL6 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp21Q9QZL6 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp21Q9QZL6 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp21Q9QZL6 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp21Q9QZL6 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp21Q9QZL6 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp21Q9QZL6 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp21Q9QZL6 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp21Q9QZL6 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp21Q9QZL6 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp21Q9QZL6 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp21Q9QZL6 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp21Q9QZL6 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp21Q9QZL6 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp21Q9QZL6 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp21Q9QZL6 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp21Q9QZL6 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp21Q9QZL6 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp21Q9QZL6 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp21Q9QZL6 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp21Q9QZL6 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp21Q9QZL6 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp21Q9QZL6 Gm12208-201ENSMUST00000122004 163 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp21Q9QZL6 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp21Q9QZL6 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp21Q9QZL6 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp21Q9QZL6 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp21Q9QZL6 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp21Q9QZL6 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp21Q9QZL6 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp21Q9QZL6 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp21Q9QZL6 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp21Q9QZL6 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp21Q9QZL6 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp21Q9QZL6 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp21Q9QZL6 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp21Q9QZL6 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp21Q9QZL6 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp21Q9QZL6 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp21Q9QZL6 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp21Q9QZL6 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp21Q9QZL6 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp21Q9QZL6 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp21Q9QZL6 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp21Q9QZL6 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp21Q9QZL6 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp21Q9QZL6 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp21Q9QZL6 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp21Q9QZL6 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp21Q9QZL6 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp21Q9QZL6 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp21Q9QZL6 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp21Q9QZL6 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp21Q9QZL6 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp21Q9QZL6 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp21Q9QZL6 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp21Q9QZL6 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp21Q9QZL6 Gm6407-201ENSMUST00000176468 549 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp21Q9QZL6 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp21Q9QZL6 Snhg8-201ENSMUST00000196466 448 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp21Q9QZL6 Gm44126-201ENSMUST00000204831 514 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp21Q9QZL6 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp21Q9QZL6 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp21Q9QZL6 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp21Q9QZL6 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms