Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY76

Vapb, Vesicle-associated membrane protein-associated protein B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VapbQ9QY76 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
VapbQ9QY76 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
VapbQ9QY76 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
VapbQ9QY76 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
VapbQ9QY76 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
VapbQ9QY76 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
VapbQ9QY76 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
VapbQ9QY76 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
VapbQ9QY76 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
VapbQ9QY76 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
VapbQ9QY76 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
VapbQ9QY76 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
VapbQ9QY76 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
VapbQ9QY76 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
VapbQ9QY76 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
VapbQ9QY76 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
VapbQ9QY76 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
VapbQ9QY76 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
VapbQ9QY76 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
VapbQ9QY76 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
VapbQ9QY76 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
VapbQ9QY76 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
VapbQ9QY76 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
VapbQ9QY76 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
VapbQ9QY76 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
VapbQ9QY76 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
VapbQ9QY76 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
VapbQ9QY76 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
VapbQ9QY76 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
VapbQ9QY76 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
VapbQ9QY76 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
VapbQ9QY76 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
VapbQ9QY76 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
VapbQ9QY76 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
VapbQ9QY76 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
VapbQ9QY76 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
VapbQ9QY76 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
VapbQ9QY76 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
VapbQ9QY76 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
VapbQ9QY76 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
VapbQ9QY76 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
VapbQ9QY76 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
VapbQ9QY76 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
VapbQ9QY76 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
VapbQ9QY76 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
VapbQ9QY76 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
VapbQ9QY76 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
VapbQ9QY76 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
VapbQ9QY76 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
VapbQ9QY76 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
VapbQ9QY76 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
VapbQ9QY76 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
VapbQ9QY76 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
VapbQ9QY76 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
VapbQ9QY76 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
VapbQ9QY76 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
VapbQ9QY76 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
VapbQ9QY76 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
VapbQ9QY76 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
VapbQ9QY76 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
VapbQ9QY76 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
VapbQ9QY76 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
VapbQ9QY76 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
VapbQ9QY76 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
VapbQ9QY76 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
VapbQ9QY76 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
VapbQ9QY76 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
VapbQ9QY76 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
VapbQ9QY76 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
VapbQ9QY76 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
VapbQ9QY76 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
VapbQ9QY76 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
VapbQ9QY76 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
VapbQ9QY76 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
VapbQ9QY76 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
VapbQ9QY76 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
VapbQ9QY76 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
VapbQ9QY76 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
VapbQ9QY76 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
VapbQ9QY76 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
VapbQ9QY76 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
VapbQ9QY76 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
VapbQ9QY76 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
VapbQ9QY76 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
VapbQ9QY76 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
VapbQ9QY76 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
VapbQ9QY76 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
VapbQ9QY76 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
VapbQ9QY76 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
VapbQ9QY76 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
VapbQ9QY76 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
VapbQ9QY76 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
VapbQ9QY76 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
VapbQ9QY76 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
VapbQ9QY76 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
VapbQ9QY76 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
VapbQ9QY76 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
VapbQ9QY76 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
VapbQ9QY76 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
VapbQ9QY76 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
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