Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXA7

Trim44, Tripartite motif-containing protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim44Q9QXA7 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim44Q9QXA7 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim44Q9QXA7 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim44Q9QXA7 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim44Q9QXA7 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim44Q9QXA7 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim44Q9QXA7 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim44Q9QXA7 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim44Q9QXA7 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim44Q9QXA7 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim44Q9QXA7 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim44Q9QXA7 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim44Q9QXA7 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim44Q9QXA7 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim44Q9QXA7 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim44Q9QXA7 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim44Q9QXA7 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim44Q9QXA7 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim44Q9QXA7 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim44Q9QXA7 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim44Q9QXA7 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim44Q9QXA7 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim44Q9QXA7 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim44Q9QXA7 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim44Q9QXA7 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim44Q9QXA7 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim44Q9QXA7 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim44Q9QXA7 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim44Q9QXA7 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim44Q9QXA7 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim44Q9QXA7 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim44Q9QXA7 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim44Q9QXA7 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim44Q9QXA7 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim44Q9QXA7 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim44Q9QXA7 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim44Q9QXA7 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim44Q9QXA7 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim44Q9QXA7 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim44Q9QXA7 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim44Q9QXA7 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim44Q9QXA7 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim44Q9QXA7 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim44Q9QXA7 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim44Q9QXA7 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim44Q9QXA7 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim44Q9QXA7 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim44Q9QXA7 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim44Q9QXA7 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim44Q9QXA7 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim44Q9QXA7 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim44Q9QXA7 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim44Q9QXA7 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim44Q9QXA7 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim44Q9QXA7 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim44Q9QXA7 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim44Q9QXA7 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim44Q9QXA7 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim44Q9QXA7 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim44Q9QXA7 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim44Q9QXA7 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim44Q9QXA7 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim44Q9QXA7 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim44Q9QXA7 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim44Q9QXA7 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Trim44Q9QXA7 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim44Q9QXA7 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim44Q9QXA7 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim44Q9QXA7 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC15.89■□□□□ 0.14
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Trim44Q9QXA7 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim44Q9QXA7 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim44Q9QXA7 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim44Q9QXA7 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim44Q9QXA7 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim44Q9QXA7 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim44Q9QXA7 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim44Q9QXA7 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim44Q9QXA7 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim44Q9QXA7 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim44Q9QXA7 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim44Q9QXA7 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim44Q9QXA7 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim44Q9QXA7 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim44Q9QXA7 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim44Q9QXA7 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim44Q9QXA7 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim44Q9QXA7 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim44Q9QXA7 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim44Q9QXA7 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim44Q9QXA7 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim44Q9QXA7 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim44Q9QXA7 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim44Q9QXA7 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim44Q9QXA7 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim44Q9QXA7 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim44Q9QXA7 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim44Q9QXA7 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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